RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 HCFC1P51610 2035 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 RBAKDNA6NC62 111 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 Q56UQ5 140 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM219BQ5XKK7 198 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 Q6ZQT7 251 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 B4DSR2 109 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 H3BMG7 143 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF688P0C7X2 276 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 MDFIQ99750 246 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 CSPG4Q6UVK1 2322 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 MPDZO75970 2070 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PS18 150 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-9P01782 118 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 COX5AP20674 150 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV1-2P23083 117 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 MSRB3Q8IXL7 192 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 GTSF1Q8WW33 167 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 K7N7A8 449 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 CHEK1O14757 476 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 SMIM13P0DJ93 91 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 SRXN1Q9BYN0 137 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC25A15Q9Y619 301 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 E7EQL1 145 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 K7EMT4 169 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 GP9P14770 177 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 EDNRAP25101 427 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 UNC119Q13432 240 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00311Q8N616 119 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF525Q8N782 197 aa3.63□□□□□ -1.83
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RABGGTB-213ENST00000496055 BRK1Q8WUW1 75 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 PRSS22Q9GZN4 317 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 CMC2Q9NRP2 79 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 MPC1Q9Y5U8 109 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 IRGMA1A4Y4 181 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV1D-16P01601 117 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 PTHLHP12272 177 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 CSN1S1P47710 185 aa3.63□□□□□ -1.83
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RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM258P61165 79 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 DNM1P46Q6ZS02 220 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 OR51H1Q8NH63 302 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF7Q9UBF6 113 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 BSNQ9UPA5 3926 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PPR1 153 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 hDV102S1A0JD36 115 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 A8MWL6 223 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 SHISA9B4DS77 424 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 DEDDO75618 318 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFB4O95168 129 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 GYPAP02724 150 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 ASIPP42127 132 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM136Q6ZRR5 245 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 JMJD1CQ15652 2540 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 FCGR2CP31995 323 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 APOC4P55056 127 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 HERV-K104P61576 105 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 UBE2G1P62253 170 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC01559Q495D7 138 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 TCF23Q7RTU1 214 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-213ENST00000496055 PCP2Q8IVA1 136 aa3.62□□□□□ -1.83
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