RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 Q8N3U1 123 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF479Q96JC4 524 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 GABARAPH6UMI1 98 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 GABARAPO95166 117 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 IGKV1-5P01602 117 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 NAT1P18440 290 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 SPCS3P61009 180 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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C9orf3-211ENST00000463372 MND1Q9BWT6 205 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 FAM231BA6NCW3 169 aa8.38□□□□□ -1.07
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C9orf3-211ENST00000463372 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.38□□□□□ -1.07
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C9orf3-211ENST00000463372 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.37□□□□□ -1.07
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C9orf3-211ENST00000463372 A0A087WYN8 130 aa8.36□□□□□ -1.07
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C9orf3-211ENST00000463372 VWC2Q2TAL6 325 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 TEPPQ6URK8 271 aa8.36□□□□□ -1.07
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C9orf3-211ENST00000463372 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 SLC35E1Q96K37 410 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-211ENST00000463372 FABP12A6NFH5 140 aa8.35□□□□□ -1.07
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C9orf3-211ENST00000463372 SSR3Q9UNL2 185 aa8.35□□□□□ -1.07
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C9orf3-211ENST00000463372 FABP5Q01469 135 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 NMSQ5H8A3 153 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 IFT46Q9NQC8 304 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.32□□□□□ -1.08
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C9orf3-211ENST00000463372 MPDU1O75352 247 aa8.32□□□□□ -1.08
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C9orf3-211ENST00000463372 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 A0A087X0K7 114 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 MYL9P24844 172 aa8.31□□□□□ -1.08
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C9orf3-211ENST00000463372 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.31□□□□□ -1.08
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C9orf3-211ENST00000463372 PRAC2D3DTV9 90 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 OR10J4P0C629 311 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 OR51M1Q9H341 326 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 AUNIPQ9H7T9 357 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.29□□□□□ -1.08
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