RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 WNT10BO00744 389 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 NXPH4O95158 308 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 SLURP2P0DP57 97 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 CCL1P22362 96 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 FOXF2Q12947 444 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF503Q96F45 646 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 IGHV3-43DP0DP04 118 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 C5orf38Q86SI9 138 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 TMEM133Q9H2Q1 129 aa4.46□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 NPPCP23582 126 aa4.46□□□□□ -1.7
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM231AP0DMU4 169 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 FAM231CP0DMU5 169 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00310P59036 64 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 BLCAPP62952 87 aa4.46□□□□□ -1.7
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PTPRC-209ENST00000442510 ALKQ9UM73 1620 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 TRPM6Q9BX84 2022 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV3A0A0B4J244 114 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 Q96MF0 132 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 ECM29Q5VYK3 1845 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 H0YGG7 62 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 IGKV1-13P0DP09 117 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 GP9P14770 177 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 ERCC8Q13216 396 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-209ENST00000442510 Q8N8P6 123 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-209ENST00000442510 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 DEC1Q9P2X7 70 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 UBR1Q8IWV7 1749 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-209ENST00000442510 PCOLCEQ15113 449 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 DEFB110Q30KQ9 67 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa4.45□□□□□ -1.7
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