RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 IMMP2LQ96T52 175 aa3.1□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TXN2Q99757 166 aa3.1□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 ATG101Q9BSB4 218 aa3.1□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 OSTCQ9NRP0 149 aa3.1□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 ZANQ9Y493 2812 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV19A0A075B6N1 114 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 A6NDX4 124 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXA5P20719 270 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 GATA3P23771 443 aa3.09□□□□□ -1.91
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LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 OTORQ9NRC9 128 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 RABAC1Q9UI14 185 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.09□□□□□ -1.91
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A096LNT2 108 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 M0R3E3 92 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 BMPR1BO00238 502 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 PHOX2AO14813 284 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 TRGV3P03979 118 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 TYMSP04818 313 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLC2P0DOY2 106 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP5G2Q06055 141 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB113Q30KQ7 82 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB112Q30KQ8 113 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 NUDT11Q96G61 164 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 BTF3L4Q96K17 158 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR82Q96P67 336 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 PITPNC1Q9UKF7 332 aa3.09□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.08□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 CBLN1P23435 193 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 PRNTQ86SH4 94 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 C12orf57Q99622 126 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ASCL2Q99929 193 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 CREBBPQ92793 2442 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 XKRY2A2RUG3 117 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3-11P01762 117 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV4-59P01825 116 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHG2P01859 326 aa3.08□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 LCNL1Q6ZST4 164 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 FMC1Q96HJ9 113 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 Q96MF0 132 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC168Q8NDH2 2452 aa3.08□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 KLK9Q2XQG4 91 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM209BQ5JX69 171 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
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LRRTM4-201ENST00000409088 MLST8Q9BVC4 326 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 KLK15Q9H2R5 256 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.08□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.07□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 IFITM10A6NMD0 228 aa3.07□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF785A8K8V0 405 aa3.07□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 SNURFLB1AK76 121 aa3.07□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 J3QLI3 93 aa3.07□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 K7EQM0 130 aa3.07□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 LTAP01374 205 aa3.07□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 IGF1P05019 195 aa3.07□□□□□ -1.92
LRRTM4-201ENST00000409088 S100A8P05109 93 aa3.07□□□□□ -1.92
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