RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 RRN3P1Q2M238 152 aa9.85□□□□□ -0.83
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SZRD1-201ENST00000401088 TTTY12Q9BZ98 90 aa9.85□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.85□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 LOXL3P58215 753 aa9.85□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa9.84□□□□□ -0.83
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SZRD1-201ENST00000401088 A6NJY4 79 aa9.84□□□□□ -0.83
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SZRD1-201ENST00000401088 GAGE2EQ4V326 116 aa9.84□□□□□ -0.83
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SZRD1-201ENST00000401088 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.84□□□□□ -0.83
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SZRD1-201ENST00000401088 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 K7ESF4 209 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 ATP5LO75964 103 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 ERG28Q9UKR5 140 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
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SZRD1-201ENST00000401088 SCNM1Q9BWG6 230 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 M0R3E3 92 aa9.82□□□□□ -0.84
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SZRD1-201ENST00000401088 ZGRF1Q86YA3 2104 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 A8MWV9 139 aa9.82□□□□□ -0.84
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SZRD1-201ENST00000401088 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.82□□□□□ -0.84
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SZRD1-201ENST00000401088 TM2D2Q9BX73 214 aa9.81□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM262E9PQX1 116 aa9.81□□□□□ -0.84
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SZRD1-201ENST00000401088 VCX2Q9H322 139 aa9.81□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.81□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 DSCAML1Q8TD84 2053 aa9.8□□□□□ -0.84
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SZRD1-201ENST00000401088 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.8□□□□□ -0.84
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SZRD1-201ENST00000401088 IGHV1-2P23083 117 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 POU2AF1Q16633 256 aa9.8□□□□□ -0.84
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SZRD1-201ENST00000401088 H7C2G1 150 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 WISP2O76076 250 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 GAGE7O76087 117 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 GAGE12FP0CL80 117 aa9.8□□□□□ -0.84
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SZRD1-201ENST00000401088 GAGE12IP0CL82 117 aa9.8□□□□□ -0.84
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SZRD1-201ENST00000401088 ODF1Q14990 250 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 AGRNO00468 2067 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 MYCNOSP40205 109 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 C8orf49Q96NF6 230 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 VKORC1Q9BQB6 163 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-201ENST00000401088 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
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