RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-201ENST00000325599 FANCD2OSQ96PS1 177 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-201ENST00000325599 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-201ENST00000325599 M0R3E3 92 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-201ENST00000325599 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-201ENST00000325599 RAB9AP51151 201 aa12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-201ENST00000325599 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa12.85□□□□□ -0.35
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