RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa13.69□□□□□ -0.22
PTX4-201ENST00000293922 PAXXQ9BUH6 204 aa13.69□□□□□ -0.22
PTX4-201ENST00000293922 OR51M1Q9H341 326 aa13.69□□□□□ -0.22
PTX4-201ENST00000293922 MLXQ9UH92 298 aa13.69□□□□□ -0.22
PTX4-201ENST00000293922 IZUMO1RA6ND01 250 aa13.68□□□□□ -0.22
PTX4-201ENST00000293922 HBE1P02100 147 aa13.68□□□□□ -0.22
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PTX4-201ENST00000293922 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa13.68□□□□□ -0.22
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PTX4-201ENST00000293922 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa13.67□□□□□ -0.22
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PTX4-201ENST00000293922 DEFB114Q30KQ6 69 aa13.66□□□□□ -0.22
PTX4-201ENST00000293922 CLLU1Q5K131 121 aa13.66□□□□□ -0.22
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PTX4-201ENST00000293922 C17orf77Q96MU5 243 aa13.66□□□□□ -0.22
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PTX4-201ENST00000293922 C19orf73Q9NVV2 129 aa13.65□□□□□ -0.22
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PTX4-201ENST00000293922 RYR3Q15413 4870 aa13.64□□□□□ -0.23
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PTX4-201ENST00000293922 SAMD13Q5VXD3 122 aa13.6□□□□□ -0.23
PTX4-201ENST00000293922 DCANP1Q8TF63 244 aa13.6□□□□□ -0.23
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
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PTX4-201ENST00000293922 FAM74A7A6NL05 159 aa13.57□□□□□ -0.24
PTX4-201ENST00000293922 K7EQG2 157 aa13.57□□□□□ -0.24
PTX4-201ENST00000293922 IFNA1P01562 189 aa13.57□□□□□ -0.24
PTX4-201ENST00000293922 RANP62826 216 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
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PTX4-201ENST00000293922 GUCA2BQ16661 112 aa13.57□□□□□ -0.24
PTX4-201ENST00000293922 TUBA4BQ9H853 241 aa13.57□□□□□ -0.24
PTX4-201ENST00000293922 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa13.56□□□□□ -0.24
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