RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.7□□□□□ -1.02
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SPC25-201ENST00000282074 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.7□□□□□ -1.02
SPC25-201ENST00000282074 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.69□□□□□ -1.02
SPC25-201ENST00000282074 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.69□□□□□ -1.02
SPC25-201ENST00000282074 CGB1A6NKQ9 187 aa8.69□□□□□ -1.02
SPC25-201ENST00000282074 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
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SPC25-201ENST00000282074 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.68□□□□□ -1.02
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SPC25-201ENST00000282074 PSENENQ9NZ42 101 aa8.68□□□□□ -1.02
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SPC25-201ENST00000282074 IGKV1-5P01602 117 aa8.67□□□□□ -1.02
SPC25-201ENST00000282074 FHITP49789 147 aa8.67□□□□□ -1.02
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SPC25-201ENST00000282074 C12orf57Q99622 126 aa8.67□□□□□ -1.02
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SPC25-201ENST00000282074 CST7O76096 145 aa8.66□□□□□ -1.02
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SPC25-201ENST00000282074 Q56UQ5 140 aa8.66□□□□□ -1.02
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SPC25-201ENST00000282074 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.66□□□□□ -1.02
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SPC25-201ENST00000282074 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.65□□□□□ -1.02
SPC25-201ENST00000282074 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SPC25-201ENST00000282074 SMCO3A2RU48 225 aa8.65□□□□□ -1.02
SPC25-201ENST00000282074 C16orf90A8MZG2 172 aa8.65□□□□□ -1.02
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SPC25-201ENST00000282074 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.64□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 CTSGP08311 255 aa8.64□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 AKR1D1P51857 326 aa8.64□□□□□ -1.03
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SPC25-201ENST00000282074 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.64□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 Q6ZR54 194 aa8.64□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 Q6ZRM9 215 aa8.64□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 TCF24Q7RTU0 167 aa8.64□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 LILRB2Q8N423 598 aa8.64□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.64□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 HERC1Q15751 4861 aa8.64□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 FNDC10F2Z333 226 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 HPRT1P00492 218 aa8.63□□□□□ -1.03
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