RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 VCX2Q9H322 139 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 CTSZQ9UBR2 303 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF580Q9UK33 172 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TIMM23O14925 209 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 OR11H12B2RN74 326 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 PROP1O75360 226 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 FOXL1Q12952 345 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 CT83Q5H943 113 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 NPBQ8NG41 125 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 USMG5Q96IX5 58 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 H3BUX3 64 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TYMSP04818 313 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 OTORQ9NRC9 128 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 ADAMTS20P59510 1910 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 K7ERU9 68 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF134P52741 427 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 HBBP68871 147 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 INSP01308 110 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV2-5P01817 119 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 C1QTNF9P0C862 333 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 IGFBP2P18065 325 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 COTL1Q14019 142 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 FMC1Q96HJ9 113 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 IGLV2-14P01704 120 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 DOCK7Q96N67 2140 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 JPT2Q9H910 190 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TFF1P04155 84 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 COL8A2P25067 703 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM86BQ8N661 226 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 Q9H3A6 140 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 A0A0U1RRA0 63 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 F5H768 121 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV4-39P01824 125 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 DEFB130BP0DP73 79 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 DEFB130AP0DP74 79 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 SRIP30626 198 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 CENPWQ5EE01 88 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 OR11H1Q8NG94 326 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 OR11H2Q8NH07 326 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TCF21O43680 179 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TEX38Q6PEX7 206 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 FAM223BA6NKX1 122 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 BRI3O95415 125 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 DAD1P61803 113 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 RNF125Q96EQ8 232 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 USF3Q68DE3 2245 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 ODF3BA8MYP8 253 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF329Q86UD4 541 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 LRRK2Q5S007 2527 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 LINC01549A6NIU2 74 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 NPC2P61916 151 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 NRN1Q9NPD7 142 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 A0A1W2PPI3 338 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 CFHR3Q02985 330 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TFF3Q07654 80 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 LCN12Q6JVE5 192 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 MSMBP08118 114 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 LINC01559Q495D7 138 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.59□□□□□ -1.35
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