RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.83□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.83□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 PTPN13Q12923 2485 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 FBN2P35556 2912 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 DEFB1P60022 68 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 ECSCRQ19T08 205 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 RNF182Q8N6D2 247 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 K7ENP7 123 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 CHEK1O14757 476 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 GNG7O60262 68 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 NDUFB8O95169 186 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 HTR1DP28221 377 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 DNLZQ5SXM8 178 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 Q86TA4 180 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 TMEM219Q86XT9 240 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 LINC00311Q8N616 119 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 MLST8Q9BVC4 326 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 NGBQ9NPG2 151 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 G3V318 75 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 NCR2O95944 276 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 CA7P43166 264 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 HBBP68871 147 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 ZNF124Q15973 351 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 RNF2Q99496 336 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 TRGV9Q99603 122 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 IGLC2P0DOY2 106 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 IGLC3P0DOY3 106 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 UQCRFS1P47985 274 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 ERCC8Q13216 396 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 CFAP161Q6P656 301 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 LTAP01374 205 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 MT-ND6P03923 174 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 ESDP10768 282 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 CTRLP40313 264 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 RNF125Q96EQ8 232 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 VGLL1Q99990 258 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.81□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 C2orf70A6NJV1 201 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 NBR2O15453 112 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 TCF21O43680 179 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 HLA-DRB1P01911 266 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 OR4A5Q8NH83 315 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 NF1P21359 2839 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 TOMM40O96008 361 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 LIPFP07098 398 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 C1RLQ9NZP8 487 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 DPM3Q9P2X0 92 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GXF2 115 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 PRAC2D3DTV9 90 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 GPR183P32249 361 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 RBPJQ06330 500 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 AMN1Q8IY45 258 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 ZNF596Q8TC21 504 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 A8MWL6 223 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 LY6LH3BQJ8 138 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 PSG8Q9UQ74 426 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 OR4C46A6NHA9 309 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 F8W735 103 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 CFHR4Q92496 578 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.79□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 FOSL1P15407 271 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 NBL1P41271 181 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms