RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.76□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 C12orf74Q32Q52 190 aa5.76□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.76□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 Q6AWC8 147 aa5.76□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.76□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 SYT8Q8NBV8 401 aa5.76□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 PRO3102Q9H379 93 aa5.76□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 U3KQK5 164 aa5.76□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 NAV3Q8IVL0 2385 aa5.76□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM213A2RRL7 107 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 C16orf97H3BN30 126 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 TSPAN13O95857 204 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 C10orf55Q5SWW7 151 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF785A8K8V0 405 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 OR11H12B2RN74 326 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 PRSS1P07477 247 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 CKS2P33552 79 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 PAX8Q06710 450 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 MZT1Q08AG7 82 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 OR11H1Q8NG94 326 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 OR11H2Q8NH07 326 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 PRO0461Q9UI25 63 aa5.75□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 IGKCP01834 107 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 FOXI1Q12951 378 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 RNF183Q96D59 192 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 SMKR1H3BMG3 65 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 NPYP01303 97 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 MT-ATP8P03928 68 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 KLRD1Q13241 179 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 ODF1Q14990 250 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM178AQ8NBL3 297 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 C8orf46Q8TAG6 207 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 CDIP1Q9H305 208 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 AGRNO00468 2067 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 CGB1A6NKQ9 187 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 SHISA9B4DS77 424 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 PRRG2O14669 202 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 GATA3P23771 443 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 FCER1GP30273 86 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 RRN3P1Q2M238 152 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 TDHQ8IZJ6 230 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 SAP25Q8TEE9 199 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 TRGV9Q99603 122 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 ZMAT4Q9H898 229 aa5.74□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 DSCAMO60469 2012 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 TNFRSF1AP19438 455 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 CRIP1P50238 77 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 FAM201AQ5SY85 155 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 MOGAT3Q86VF5 341 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 OR10X1Q8NGY0 326 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 HIST1H4GQ99525 98 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 ERG28Q9UKR5 140 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 PSG8Q9UQ74 426 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 VSTM5A8MXK1 200 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 EVI2AP22794 236 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 TAL2Q16559 108 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 HCP5Q6MZN7 132 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 PLCE1Q9P212 2302 aa5.73□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 A6NJY4 79 aa5.72□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 DPM2O94777 84 aa5.72□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 LEPP41159 167 aa5.72□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 LYZP61626 148 aa5.72□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 Q6ZUT4 128 aa5.72□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.72□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.72□□□□□ -1.49
CSDE1-201ENST00000261443 RITA1Q96K30 269 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms