RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.52□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 DLX1P56177 255 aa8.52□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 WT1-ASQ06250 92 aa8.52□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.52□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PRE2 83 aa8.52□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.52□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 H3BUX3 64 aa8.52□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 IGLV1-47P01700 117 aa8.52□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.52□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
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PRRX1-201ENST00000239461 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.52□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.52□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.52□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 TRGV9Q99603 122 aa8.52□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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PRRX1-201ENST00000239461 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.51□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 CT45A10P0DMU9 189 aa8.51□□□□□ -1.05
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PRRX1-201ENST00000239461 UBE2E1P51965 193 aa8.5□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 C1QL4Q86Z23 238 aa8.5□□□□□ -1.05
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PRRX1-201ENST00000239461 CENPWQ5EE01 88 aa8.5□□□□□ -1.05
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PRRX1-201ENST00000239461 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.49□□□□□ -1.05
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PRRX1-201ENST00000239461 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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PRRX1-201ENST00000239461 LINC01551Q86U37 167 aa8.48□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.48□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.48□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.48□□□□□ -1.05
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PRRX1-201ENST00000239461 A4D1N5 150 aa8.47□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.47□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 C9JCJ5 164 aa8.47□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 PEX7O00628 323 aa8.47□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 THAP8Q8NA92 274 aa8.47□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.47□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 CXCL1P09341 107 aa8.47□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 PYYP10082 97 aa8.47□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 ID1P41134 155 aa8.47□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.47□□□□□ -1.05
PRRX1-201ENST00000239461 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.47□□□□□ -1.05
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