RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ctdsp1P58466 261 aa15.02■□□□□ -0
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Loxl1P97873 607 aa15.02■□□□□ -0
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smim6Q3U0I6 56 aa15.02■□□□□ -0
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SspnQ62147 216 aa15.02■□□□□ -0
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tbpl2Q6SJ95 350 aa15.02■□□□□ -0
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spcs3Q6ZWQ7 180 aa15.02■□□□□ -0
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 H2-M10.6Q85ZW5 330 aa15.02■□□□□ -0
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr736Q8VFT6 312 aa15.02■□□□□ -0
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gtsf1Q9DAN6 167 aa15.02■□□□□ -0
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm20825J3QM67 227 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bloc1s1O55102 125 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ApohQ01339 345 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dhrs2Q149L0 282 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ssty2Q149W4 227 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rtl4Q3URY0 304 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21394Q497R7 227 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm20854Q62461 227 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr25Q7TRD6 313 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FuomQ8R2K1 153 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr113Q8VEU4 312 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr473Q8VG44 310 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr641Q8VGX6 312 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plxdc1Q91ZV7 500 aa15.02□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm20773A0A0A6YXW2 232 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm20807A0A0A6YXX7 232 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm20873J3QMQ9 232 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm20795J3QP49 232 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21310J3QQ23 232 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Asgr2P24721 301 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Crisp3Q03402 241 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tppp2Q0P5Y3 170 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21440Q3TTD8 232 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trat1Q3UU67 187 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trav6-2Q5R1I4 113 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wdr83osQ6ZWX0 106 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr153Q7TR48 307 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr987Q7TRA2 309 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1412Q8VET3 321 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpusd4Q9CWX4 377 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lamp5Q9D387 280 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trem3Q9JKE1 183 aa15.01□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv9-3A0A0B4J1J5 117 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp36l1P23950 338 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rom1P32958 351 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rps10P63325 165 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lax1Q8BHB3 407 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp459Q8BZ17 267 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HpxQ91X72 460 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hspb9Q9DAM3 168 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fhl3Q9R059 289 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vps13cQ8BX70 3748 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Inafm1E9PV59 130 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P04940 107 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P04941 107 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NdnP25233 325 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Meox1P32442 253 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q3U1D9 316 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AgerQ62151 402 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tff3Q62395 81 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Alkbh6Q8K2U2 238 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gtf3aQ8VHT7 364 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fgfrl1Q91V87 529 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rnf151Q9CQ29 239 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bpifa5Q9CQX3 270 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10306Q9CUK2 115 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ms4a4bQ9ES61 226 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem9bQ9JJR8 199 aa15□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PkdrejQ9Z0T6 2126 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gfod1Q3UHD2 390 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AdipoqQ60994 247 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trib1Q8K4K4 372 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znhit1Q8R331 154 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Exosc2Q8VBV3 293 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr76Q8VFV2 317 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cma2Q91VB1 246 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc198Q9CPZ1 294 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem128Q9CZB9 163 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf22Q9ERU3 237 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trex2Q9R1A9 236 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rnf7Q9WTZ1 113 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arpc1bQ9WV32 372 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Crybb1Q9WVJ5 250 aa14.99□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm8653K9J7G2 307 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r117L7N2C9 307 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wnt5bP22726 359 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bmpr1bP36898 502 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 StumQ0VBF8 141 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q6DIA7 600 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TpppQ7TQD2 218 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr960Q8VET5 316 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pear1Q8VIK5 1034 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znrf1Q91V17 227 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ly96Q9JHF9 160 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Flg2Q2VIS4 2362 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pde4dipQ80YT7 2224 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm36368A0A1D5RLK8 91 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1337A2ACY8 315 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pde6dO55057 150 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01796 113 aa14.98□□□□□ -0.01
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01797 113 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.4 ms