RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 H2al3Q9D4U4 128 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r46Q9EQ45 309 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Awat1A2ADU9 328 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm14325A2AW67 498 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zcchc24B2RVL6 241 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr251E9Q891 316 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm21719J3KMI9 230 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ifna4P07351 186 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Timp1P12032 205 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 VhlP40338 181 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rbp4Q00724 201 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gpr183Q3U6B2 357 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Arl11Q6P3A9 176 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lrtm2Q8BGX3 370 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Poc1bQ8BHD1 476 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fam234aQ8C0Z1 555 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 StradbQ8K4T3 418 aa9.65□□□□□ -0.86
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr282A1L1B4 308 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Samt3A2ARK7 233 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gata2O09100 480 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 GzmfP08883 248 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hoxa5P09021 270 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm10447Q3UQ92 135 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ovch2Q7M761 609 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1474Q7TQQ8 314 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wipi1Q8R3E3 446 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Scgb1b27Q91WB5 92 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fam103a1Q9CQY2 119 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Q9CRC3 126 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 NgbQ9ER97 151 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tbx21Q9JKD8 530 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Chst4Q9R1I1 388 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dmxl1Q6PNC0 3013 aa9.65□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 A0A1L1SR50 188 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 H2-M5A7VMS3 348 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sftpa1P35242 248 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 SepsecsQ6P6M7 504 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r237Q8R296 289 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr346Q8VGJ7 309 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cysltr2Q920A1 309 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ms4a4cQ9D3F6 226 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Atg101Q9D8Z6 218 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ighv1-76A0A0G2JFE9 117 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr284A0A0U1RP76 321 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cpsf4lE9Q2N0 280 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 CortP56469 109 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem52bQ0VBF2 186 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm10384Q3UQ87 92 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm10840Q3V2K9 103 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Stac2Q8R1B0 408 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Q8VE95 218 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1457Q8VFK3 317 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rwdd3Q8VIL2 267 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm20532G3UXR8 106 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 PilraQ2YFS3 302 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mbd6Q3TY92 1003 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Smim9Q3V0X1 137 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc25a31Q3V132 320 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Plk3Q60806 631 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tspan7Q62283 249 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr577Q8VH11 312 aa9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Prpf8Q99PV0 2335 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfyve26Q5DU37 2529 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Igkv4-50A0A0B4J1J0 117 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm4884E9PVP9 694 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Atpif1O35143 106 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pet117P0DJF2 80 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hand1Q64279 216 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Coq2Q66JT7 374 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ifna13Q80SU4 189 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Psg16Q8K0U8 395 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pcgf1Q8R023 259 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 IdnkQ8R0J8 184 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1475Q8VEV6 314 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr262Q8VFV8 312 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr641Q8VGX6 312 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mettl9Q9EPL4 318 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 TslpQ9JIE6 140 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 MsmpB1AWI6 139 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm21789J3QMZ1 123 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm21870J3QPN2 123 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm21883J3QPV3 123 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr467L7N455 308 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Efna2P52801 209 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Col9a1Q05722 921 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr917Q7TRC3 309 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ankrd33Q8BXP5 385 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr223Q8VF69 319 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cacng8Q8VHW2 423 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Try5Q9QUK9 246 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Try4Q9R0T7 246 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 E430018J23RikE9PZQ8 461 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm28051J3QMA2 81 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gstp1P19157 210 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm10334Q792Y8 246 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr358Q7TRY5 330 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mob3bQ8VE04 216 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nus1Q99LJ8 297 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm10306Q9CUK2 115 aa9.63□□□□□ -0.87
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pxmp4Q9JJW0 212 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.6 ms