RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 M0R036 132 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 CORTO00230 105 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 GPR31O00270 319 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 ARPC5O15511 151 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 S100GP29377 79 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 OPRK1P41145 380 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 CCL18P55774 89 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP10-2P60368 255 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 RBX1P62877 108 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 SEC22AQ96IW7 307 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 NRN1Q9NPD7 142 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 IFT46Q9NQC8 304 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 U3KQE9 123 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 NUDT3O95989 172 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 RFX2P48378 723 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 RRN3P1Q2M238 152 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 TIGITQ495A1 244 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 SLC35G3Q8N808 338 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 OR4X1Q8NH49 305 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 Q8WTZ3 238 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 NACAE9PAV3 2078 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 USP17L23D6RBM5 183 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1-39P01597 117 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1-17P01599 117 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 PMP2P02689 132 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1D-39P04432 117 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 VPREB1P12018 145 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 RAB31Q13636 194 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 MLANAQ16655 118 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 STOML3Q8TAV4 291 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00052Q96N35 136 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 RSG1Q9BU20 258 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 ALG5Q9Y673 324 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRM-210ENST00000578916 MYCBP2O75592 4640 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 TCRBP04435 133 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 DEFB1P60022 68 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 DHODHQ02127 395 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 MTURNQ8N3F0 131 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 ENY2Q9NPA8 101 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 F5H768 121 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 M0QXV9 152 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 SIVA1O15304 175 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 S100A8P05109 93 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 IL4P05112 153 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 ETV6P41212 452 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 TAS2R46P59540 309 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 PSG9Q00887 426 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 CLINT1Q14677 625 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 TTC32Q5I0X7 151 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 IDNKQ5T6J7 187 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 Q5VSD8 79 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF709Q8N972 641 aa6.38□□□□□ -1.39
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