RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa19.06■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLF12Q9Y4X4 402 aa19.06■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNFRSF19Q9NS68 423 aa19.05■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYO18BQ8IUG5 2567 aa19.05■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HIGD1CA8MV81 97 aa19.05■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DLEU1O43261 78 aa19.05■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR2J3O76001 311 aa19.05■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NTF3P20783 257 aa19.05■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PERPQ96FX8 193 aa19.05■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHRDL1Q9BU40 450 aa19.05■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1B0GXF2 115 aa19.04■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ORM2P19652 201 aa19.04■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STXBP6Q8NFX7 210 aa19.04■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPBQ8NG41 125 aa19.04■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NDUFA3O95167 84 aa19.04■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLC2P0DOY2 106 aa19.04■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLC3P0DOY3 106 aa19.04■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MINOS1Q5TGZ0 78 aa19.04■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR1B1Q8NGR6 318 aa19.04■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MLST8Q9BVC4 326 aa19.04■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa19.04■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VPS13CQ709C8 3753 aa19.03■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BLNKQ8WV28 456 aa19.03■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C22orf15Q8WYQ4 148 aa19.03■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRGV9Q99603 122 aa19.03■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WNT10AQ9GZT5 417 aa19.03■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HYPMO75409 117 aa19.02■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBE2G1P62253 170 aa19.02■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GAGE1Q13065 139 aa19.02■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BATFQ16520 125 aa19.02■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BORCS7Q96B45 105 aa19.02■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMIM12Q96EX1 92 aa19.02■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SGK494Q96LW2 274 aa19.02■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CSMD1Q96PZ7 3565 aa19.02■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PGPA6NDG6 321 aa19.02■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa19.02■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UQCR10Q9UDW1 63 aa19.02■□□□□ 0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C5orf64Q2M2E5 130 aa19.01■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OOSP1A8MZH6 123 aa19.01■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPR82Q96P67 336 aa19.01■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GOSR1O95249 250 aa19■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NBEAP1P0C6P0 100 aa19■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GP9P14770 177 aa19■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBE2E1P51965 193 aa19■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM116Q8NCL8 245 aa19■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRSS22Q9GZN4 317 aa19■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CAMPP49913 170 aa19■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCN12Q6JVE5 192 aa19■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PIMREGQ9BSJ6 248 aa19■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM181BA6NEQ2 426 aa18.99■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPSP0C0P6 89 aa18.99■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EBLN2Q6P2I7 272 aa18.99■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF462Q96JM2 2506 aa18.99■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HSBP1O75506 76 aa18.98■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TOMM40O96008 361 aa18.98■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCF24Q7RTU0 167 aa18.98■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCA1O95477 2261 aa18.98■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM11P17152 192 aa18.98■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAJINQ3KP22 176 aa18.98■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa18.98■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATOH7Q8N100 152 aa18.98■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa18.98■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPH3ALQ9UNE2 315 aa18.98■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa18.98■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C19orf71A6NCJ1 209 aa18.97■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LTAP01374 205 aa18.97■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SAA4P35542 130 aa18.97■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TFPI2P48307 235 aa18.97■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa18.97■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP5J2P56134 94 aa18.97■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLP1P60201 277 aa18.97■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q8N6K4 173 aa18.97■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C5orf17Q8NAS9 161 aa18.97■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GTSF1Q8WW33 167 aa18.97■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 I3L2K1 104 aa18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 M0R2Z0 102 aa18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q6ZN92 141 aa18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FMC1Q96HJ9 113 aa18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF492Q9P255 531 aa18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPG11Q96JI7 2443 aa18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C2orf70A6NJV1 201 aa18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PMCHL1Q16048 86 aa18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CT83Q5H943 113 aa18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRR31Q5SQ13 230 aa18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM120AOSQ5T036 256 aa18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LEMD1Q68G75 181 aa18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AJUBAQ96IF1 538 aa18.96■□□□□ 0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCRAP04437 139 aa18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms