RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 NWD2Q9ULI1 1742 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 HCFC1P51610 2035 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 LAMA4Q16363 1823 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1671Q9BY89 1806 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV41A0A0B4J266 112 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 hDV102S1A0JD36 115 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RBAKDNA6NC62 111 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 FXYD1O00168 92 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRM-204ENST00000577468 SSSCA1O60232 199 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 C1QAP02745 245 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 HLA-DPB1P04440 258 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 GYPBP06028 91 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM13P0DJ93 91 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PLA2G2AP14555 144 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 CRISP2P16562 243 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ELK1P19419 428 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 CBLN1P23435 193 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 CD70P32970 193 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 MP68P56378 58 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 NPC2P61916 151 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 CDK5R1Q15078 307 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRM-204ENST00000577468 STPG1Q5TH74 334 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 FAM57BQ71RH2 274 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF329Q86UD4 541 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TEN1Q86WV5 123 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 MKXQ8IYA7 352 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RFESDQ8TAC1 157 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 FAM213BQ8TBF2 198 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRM-204ENST00000577468 DCANP1Q8TF63 244 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM158Q8WZ71 300 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 AQP3Q92482 292 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 NMES1Q9C002 83 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TNFRSF19Q9NS68 423 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF581Q9P0T4 197 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 C4AP0C0L4 1744 aa2.34□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 C4BP0C0L5 1744 aa2.34□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 DOCK4Q8N1I0 1966 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 C4orf51C9J302 202 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 M0R378 163 aa2.33□□□□□ -2.04
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R3DO95685 299 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV1-13P0DP09 117 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 DAPP51397 102 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP10-12P60413 245 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 KRTDAPP60985 99 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00303Q3SY05 128 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM136Q6ZRR5 245 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 LCA10Q71F78 164 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 SH2D6Q7Z4S9 175 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 PCP2Q8IVA1 136 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 AMN1Q8IY45 258 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 RAB42Q8N4Z0 105 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 C3orf56Q8N813 242 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 C15orf53Q8NAA6 179 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 OR10G2Q8NGC3 310 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 OR8A1Q8NGG7 326 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 OR5C1Q8NGR4 320 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 TOMM6Q96B49 74 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00479Q96M42 142 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 CHCHD5Q9BSY4 110 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 CST11Q9H112 138 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 CTSZQ9UBR2 303 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 LAMB2P55268 1798 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ALS2Q96Q42 1657 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRM-204ENST00000577468 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa2.32□□□□□ -2.04
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