RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934		Q8N2B8	174 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	DCUN1D4	Q92564	292 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	HYLS1	Q96M11	299 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	P2RX4	Q99571	388 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	WFDC1	Q9HC57	220 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ENY2	Q9NPA8	101 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PARP11	Q9NR21	331 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934		U3KQ87	197 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TCF21	O43680	179 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TSC22D2	O75157	780 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV3-48	P01763	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	IFNA4	P05014	189 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CRYBA1	P05813	215 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	NPY1R	P25929	384 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SNCA	P37840	140 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	HTR2B	P41595	481 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TMUB2	Q71RG4	321 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	STPG2	Q8N412	459 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	OR1P1	Q8NH06	330 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	LINC01006	Q8NI28	216 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	AQP10	Q96PS8	301 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	MFF	Q9GZY8	342 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934		S4R3C0	116 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934		I3L2K1	104 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934		K7EIM0	57 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	OR2J3	O76001	311 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	MT-CO2	P00403	227 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	PET100	P0DJ07	73 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	DEFA4	P12838	97 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	FOLR2	P14207	255 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	SULT1A1	P50225	295 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	RAB9A	P51151	201 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	RAB11A	P62491	216 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	DEFA5	Q01523	94 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	OR2F1	Q13607	317 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	KLK9	Q2XQG4	91 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	OR4F5	Q8NH21	305 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	C16orf95	Q9H693	158 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	HSPB11	Q9Y547	144 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	RFNG	Q9Y644	331 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	MTOR	P42345	2549 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	VPS13C	Q709C8	3753 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0D9SG52	128 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	PSMB11	A5LHX3	300 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFA7	O95182	113 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	BRI3	O95415	125 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV3-23	P01764	117 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	IGHG4	P01861	327 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	TRGV3	P03979	118 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	OR8U8	P0C7N1	319 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	PSMB8	P28062	276 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	S100A11	P31949	105 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
LINS1-210	ENST00000560934	OPRK1	P41145	380 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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