RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	SNAPC5	O75971	98 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	IGHV3-48	P01763	117 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	HLA-DQB1	P01920	261 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	PRM2	P04554	102 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	CRYGD	P07320	174 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	CTXN2	P0C2S0	81 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	AZU1	P20160	251 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	RORC	P51449	518 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	TAS2R60	P59551	318 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	ERVK-16	P61578	105 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	POU2AF1	Q16633	256 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	GPR141	Q7Z602	305 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	SMIM19	Q96E16	107 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	PECR	Q9BY49	303 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686		G3V2T6	193 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	RLN2	P04090	185 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	FCER2	P06734	321 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	FCGR3A	P08637	254 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	HTN1	P15515	57 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	RANBP1	P43487	201 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	PSMB3	P49720	205 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	PRCD	Q00LT1	54 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	DHODH	Q02127	395 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB11B	Q15907	218 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686		Q8WTZ3	238 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM203	Q969S6	136 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	S100A14	Q9HCY8	104 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	C8orf4	Q9NR00	106 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	DOK5	Q9P104	306 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	PRND	Q9UKY0	176 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB26	Q9ULW5	256 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A0A6YYD4	124 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A0J9YX75	114 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	LALBA	P00709	142 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	TALDO1	P37837	337 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	ARPC4	P59998	168 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	DEFB1	P60022	68 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	CATR1	Q13166	79 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	P2RY14	Q15391	338 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	LINC01600	Q96MT4	127 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	RPRM	Q9NS64	109 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	KLK11	Q9UBX7	282 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A0D9SG52	128 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686		C9JCJ5	164 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	CLN5	O75503	358 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	UCP1	P25874	307 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	SNCA	P37840	140 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	QRFP	P83859	136 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	SLA	Q13239	276 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	MSMO1	Q15800	293 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	XAF1	Q6GPH4	301 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686		Q6ZS49	121 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	OR52E5	Q8NH55	327 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB3C	Q96E17	227 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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