RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GCSHP23434 173 aa4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPY1RP25929 384 aa4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PAX9P55771 341 aa4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBA52P62987 128 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q8N6K4 173 aa4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM252Q8N6L7 170 aa4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBAC2Q8NBM4 344 aa4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARPC1AQ92747 370 aa4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRAP2Q96G30 205 aa4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa4.44□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A6NDX4 124 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CORTO00230 105 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC17A3O00476 420 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CST7O76096 145 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HLA-DRB1P01911 266 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C8orf88P0DMB2 117 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SRD5A1P18405 259 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CXCL2P19875 107 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 S100A2P29034 98 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM78BQ5VT40 261 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q6YL49 198 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM219Q86XT9 240 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STHQ8IWL8 128 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM217Q8N7C4 229 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR5C1Q8NGR4 320 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIST1H2BAQ96A08 127 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ISOC2Q96AB3 205 aa4.43□□□□□ -1.7
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRO1933Q9H354 126 aa4.43□□□□□ -1.7
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 THYN1Q9P016 225 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF222A6NCQ9 220 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MSGN1A6NI15 193 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INS-IGF2F8WCM5 200 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 G3V3Q6 166 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 M0QZ24 198 aa4.43□□□□□ -1.7
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LY6G6DO95868 133 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYOD1P15172 320 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FGF7P21781 194 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPIFP30405 207 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C2orf83Q53S99 150 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q8N1X5 172 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM86BQ8N661 226 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C5orf56Q8N8D9 126 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF709Q8N972 641 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q8N9W7 124 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RXFP4Q8TDU9 374 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC35E1Q96K37 410 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP5SQ99766 215 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PARP11Q9NR21 331 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 V9GYY9 64 aa4.43□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFNA1P01562 189 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV4-59P01825 116 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERVFC1-1P60608 527 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CX3CL1P78423 397 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DLK1P80370 383 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC35E3Q7Z769 313 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SGMS2Q8NHU3 365 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM147Q9BVK8 224 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C11orf1Q9H5F2 150 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPVFQ9HCQ7 196 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UQCC1Q9NVA1 299 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.42□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa4.41□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C15orf62A8K5M9 175 aa4.41□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNG7O60262 68 aa4.41□□□□□ -1.7
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APOC3P02656 99 aa4.41□□□□□ -1.7
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