RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 TNCP24821 2201 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 TEX15Q9BXT5 2789 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 PITX3O75364 302 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 MPC2O95563 127 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 CCL3L1P16619 93 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 CXCL2P19875 107 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 MYCNOSP40205 109 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 TCL1AP56279 114 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 LGI3Q8N145 548 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00311Q8N616 119 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 SLC35G3Q8N808 338 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 OR9G1Q8NH87 305 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 PIFOQ8TCI5 191 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ABHD14BQ96IU4 210 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 C2orf50Q96LR7 162 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF714Q96N38 554 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 OCR1Q9BZK8 76 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 OR2D2Q9H210 308 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 XCL2Q9UBD3 114 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 PSG11Q9UQ72 335 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 A0A087X002 238 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 IGKV1-5P01602 117 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 IGLV1-47P01700 117 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 RBP4P02753 201 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 SLC25A6P12236 298 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF137PP52743 207 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 S100A12P80511 92 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 AVPI1Q5T686 147 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 Q8N7P7 452 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 OR51H1Q8NH63 302 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 LEAP2Q969E1 77 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 VAX2Q9UIW0 290 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.911e-11■■■■□ 24.8
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 A8MXK9 166 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 LINC01619G3V211 115 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 SNAPC5O75971 98 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3-7P01780 117 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 RPL12P30050 165 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 CACNG7P62955 275 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF345Q14585 488 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 LTC4SQ16873 150 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 LCN12Q6JVE5 192 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF525Q8N782 197 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 OR8B3Q8NGG8 313 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 GPR146Q96CH1 333 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 OR8B2Q96RD0 313 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 COA4Q9NYJ1 87 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 OR5AC2Q9NZP5 309 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 HSPB11Q9Y547 144 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 PLXNB1O43157 2135 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 ITPR3Q14573 2671 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 LY6LH3BQJ8 138 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 K7EPK0 472 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 DEDDO75618 318 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 IFNA21P01568 189 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 P01737 135 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 NFYBP25208 207 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 S100GP29377 79 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 LPAR6P43657 344 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 HCP5Q6MZN7 132 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF695Q8IW36 515 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 OR4C13Q8NGP0 309 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 OR1S1Q8NH92 325 aa3.09□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms