RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNCAP37840 140 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCL1AP56279 114 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBE2D3P61077 147 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSPAN5P62079 268 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 VSNL1P62760 191 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTAG1AP78358 180 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 EFNB1P98172 346 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 STX3Q13277 289 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 RHOHQ15669 191 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 MIAQ16674 131 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GFI1BQ5VTD9 330 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATRAIDQ6UW56 229 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 DHRS11Q6UWP2 260 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 DLEU7Q6UYE1 221 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYS1Q8N2H4 156 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 C15orf54Q8N8G6 183 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 MNS1Q8NEH6 495 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPATA4Q8NEY3 305 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC24A4Q8NFF2 622 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSPAN14Q8NG11 270 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR1S2Q8NGQ3 325 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRC20Q8TCA0 184 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 LGALS14Q8TCE9 139 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB3CQ96E17 227 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAJC30Q96LL9 226 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAAP24Q9BTP7 215 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHCHD7Q9BUK0 85 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM222Q9H0R3 208 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A32Q9H2D1 315 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 BANF2Q9H503 90 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLN6Q9NWW5 311 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SSR3Q9UNL2 185 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLF12Q9Y4X4 402 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR51B2Q9Y5P1 312 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV4A0A0B4J268 109 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRDCB7Z8K6 153 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 F5H697 171 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 G3V2T6 193 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SOCS3O14543 225 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 FABP7O15540 132 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNFSF12O43508 249 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANGP03950 147 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 RD3LP0DJH9 198 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PGAM2P15259 253 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ORM2P19652 201 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSMB9P28065 219 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 BDKRB2P30411 391 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 LEPP41159 167 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPA13P48723 471 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 AMTP48728 403 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAS2R31P59538 309 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPP30P78346 268 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF90Q03938 601 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 CATR1Q13166 79 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 BTN1A1Q13410 526 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GINS1Q14691 196 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 P2RY14Q15391 338 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB11BQ15907 218 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 MUC21Q5SSG8 566 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1orf194Q5T5A4 169 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 CFAP161Q6P656 301 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 C6orf201Q7Z4U5 140 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPAG16Q8N0X2 631 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM89BQ8N5H3 189 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 JAGN1Q8N5M9 183 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10P1Q8NGE3 313 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR9Q2Q8NGE9 314 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR8J3Q8NGG0 315 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR8A1Q8NGG7 326 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4D10Q8NGI6 311 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR51A4Q8NGJ6 313 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10G4Q8NGN3 311 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4A4PQ8NGN8 299 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM59Q9BXS4 323 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCSTAMPQ9H295 470 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A22Q9H936 323 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPCSQ9HAB8 311 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 C12orf4Q9NQ89 552 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM140Q9NV12 185 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRR34Q9NV39 138 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 IMPAD1Q9NX62 359 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAS2R8Q9NYW2 309 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAS2R4Q9NYW5 299 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFAF4Q9P032 175 aa1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms