RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503501.1

SENP6-212, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 2,041 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-212ENST00000503501 F5H768 121 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 F8W1H4 67 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 SULT1C2O00338 296 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 ADAP1O75689 374 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 SNAP29O95721 258 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 PPYP01298 95 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 LIMS3P0CW19 117 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 LIMS4P0CW20 117 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 ANXA8P13928 327 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 S100A7P31151 101 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 HAAOP46952 286 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 RAB13P51153 203 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 CCL20P78556 96 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 EDDM3AQ14507 147 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 ANGPT1Q15389 498 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 C1orf194Q5T5A4 169 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 ANXA8L1Q5VT79 327 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 LRRC6Q86X45 466 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 OR2T27Q8NH04 317 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 YPEL2Q96QA6 119 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 CNFNQ9BYD5 112 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 TRIM4Q9C037 500 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 RGCCQ9H4X1 137 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 IL36BQ9NZH7 164 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 CKLFQ9UBR5 152 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 PSME2Q9UL46 239 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 ANAPC10Q9UM13 185 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 V9GYY5 206 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 ERVK-7P63135 1459 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 PBRM1Q86U86 1689 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-0.68□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 A0A1W2PPV4 95 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 METTL15A6NJ78 407 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 F5H5K5 113 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 M0R233 179 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 SNX4O95219 450 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 BRI3O95415 125 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 PRM2P04554 102 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 GP1BAP07359 652 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 SRP19P09132 144 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 CASQ1P31415 396 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 RHEBQ15382 184 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 ZNF56Q15929 161 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 GUK1Q16774 197 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 EXOC3L4Q17RC7 722 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 OCIAD2Q56VL3 154 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 GLYATL3Q5SZD4 288 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 C2orf82Q6UX34 121 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 Q8IYB0 196 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 OR5A1Q8NGJ0 315 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 OR8D4Q8NGM9 314 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 TERB2Q8NHR7 220 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 Q8TAT8 98 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 PPCDCQ96CD2 204 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 RBP7Q96R05 134 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 CXorf21Q9HAI6 301 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 HES4Q9HCC6 221 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 GPR84Q9NQS5 396 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 COMMD9Q9P000 198 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 IFNKQ9P0W0 207 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 RIC1Q4ADV7 1423 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 NUP98P52948 1817 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 MRC1P22897 1456 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 PTPRMP28827 1452 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 A0A096LNT2 108 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 A0A0A6YYH2 397 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 BICDL2A1A5D9 508 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 A6NJ64 397 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 NDUFS8O00217 210 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 AZIN1O14977 448 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 SULT1C4O75897 302 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 GALP22466 123 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 PEX19P40855 299 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 BCAP31P51572 246 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 DPPA3Q6W0C5 159 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 FOXI2Q6ZQN5 318 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 AHSA2Q719I0 299 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 Q8N402 240 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-212ENST00000503501 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms