RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476472.5

ANKRD28-209, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 594 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-209ENST00000476472 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 HMGN2P46Q86SG4 172 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 RAB42Q8N4Z0 105 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 THAP8Q8NA92 274 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 LRRC29Q8WV35 223 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 ODF3Q96PU9 254 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 NMNAT3Q96T66 252 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 GLIPR2Q9H4G4 154 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 DPH3P1Q9H4G8 78 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 Q9H8V8 135 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF286AQ9HBT8 521 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 OARD1Q9Y530 152 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 SMCHD1A6NHR9 2005 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF292O60281 2723 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 CEP290O15078 2479 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 GREB1Q4ZG55 1949 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TRAV17A0A0B4J275 112 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 C2CD4DB7Z1M9 353 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 K7EMT4 169 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 BMPR1BO00238 502 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TIMM23O14925 209 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TCL1BO95988 128 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TCRAP04437 139 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 CCL1P22362 96 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 SSR2P43308 183 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 CRYBA2P53672 197 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TCF15Q12870 199 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 ERCC8Q13216 396 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 C19orf54Q5BKX5 351 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 FHL5Q5TD97 284 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 PLPP4Q5VZY2 271 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 FAM219BQ5XKK7 198 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM207Q6UWW9 146 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 PCP2Q8IVA1 136 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM158Q8WZ71 300 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 DSCR8Q96T75 97 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 GFI1Q99684 422 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 PRSS22Q9GZN4 317 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 CKLFQ9UBR5 152 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 HHLA3Q9XRX5 114 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 SELENOKQ9Y6D0 94 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 U3KQE9 123 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 UBR3Q6ZT12 1888 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 COL18A1P39060 1754 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TRGV11A0A075B6L2 103 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 hADV29S1A0JD25 119 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 LGALS9O00182 355 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 SPRY3O43610 288 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 FOXS1O43638 330 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 SYNGR2O43760 224 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 NDUFS5O43920 106 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 WISP1O95388 367 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 IL4P05112 153 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 CXCL8P10145 99 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 SAA4P35542 130 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 ERVK-16P61578 105 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 DAD1P61803 113 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 RPL38P63173 70 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM52BQ4KMG9 183 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 FAM120AOSQ5T036 256 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 C1orf140Q5VVS0 124 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 LGALS9CQ6DKI2 356 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 SERP2Q8N6R1 65 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 LINC01555Q8NAE3 123 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 LY6G5BQ8NDX9 201 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 WFDC11Q8NEX6 87 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 SPATA3Q8NHX4 192 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM230Q96A57 120 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 TM2D3Q9BRN9 247 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 DCTN5Q9BTE1 182 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 CHAC1Q9BUX1 264 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 SLC25A2Q9BXI2 301 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 IL36RNQ9UBH0 155 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-209ENST00000476472 LINC00527Q9UJ94 153 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 509.6 ms