RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468600.1

SSB-208, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 2

Gene SSB, Length 290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-208ENST00000468600 CXCL8P10145 99 aa-1.61□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 DYNLT1P63172 113 aa-1.61□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 SLAMF6Q96DU3 332 aa-1.61□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 C19orf60Q96EN9 201 aa-1.61□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 LINC00467Q9BRT7 94 aa-1.61□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 OR52A1Q9UKL2 312 aa-1.61□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa-1.61□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 MYH7BA7E2Y1 1941 aa-1.62□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 TACC2O95359 2948 aa-1.62□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-1.62□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 A0A087X0T9 212 aa-1.62□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 OR5G3P0C626 314 aa-1.62□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 CASC2Q6XLA1 102 aa-1.62□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 FUNDC1Q8IVP5 155 aa-1.62□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 C20orf27Q9GZN8 174 aa-1.62□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa-1.62□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa-1.62□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa-1.62□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-1.63□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 CAV3P56539 151 aa-1.63□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 Q5VSD8 79 aa-1.63□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 OR10AG1Q8NH19 301 aa-1.63□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 ABCA1O95477 2261 aa-1.63□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 NUP155O75694 1391 aa-1.63□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 MIA2Q96PC5 1412 aa-1.64□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-1.64□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 CD79AP11912 226 aa-1.64□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 GLYATL3Q5SZD4 288 aa-1.64□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 OR5D14Q8NGL3 314 aa-1.64□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 DNAJB3Q8WWF6 145 aa-1.64□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 PRADC1Q9BSG0 188 aa-1.64□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 PRR15LQ9BU68 103 aa-1.64□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa-1.64□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 SPG11Q96JI7 2443 aa-1.64□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 ERBINQ96RT1 1412 aa-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 K7EQZ3 153 aa-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 YKT6O15498 198 aa-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 SPRR1AP35321 89 aa-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 LRRN1Q6UXK5 716 aa-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 PBOV1Q9GZY1 135 aa-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 TREM1Q9NP99 234 aa-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 OPTCQ9UBM4 332 aa-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 CYSLTR1Q9Y271 337 aa-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 UNC13BO14795 1591 aa-1.65□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 ARHGEF11O15085 1522 aa-1.66□□□□□ -2.67
SSB-208ENST00000468600 FABP12A6NFH5 140 aa-1.66□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 CXCR6O00574 342 aa-1.66□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa-1.66□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa-1.66□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 RPS20P60866 119 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 C1orf134Q5TEV5 83 aa-1.66□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 C20orf196Q8IYI0 205 aa-1.66□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 GGACTQ9BVM4 153 aa-1.66□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-1.66□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 OR51I1Q9H343 314 aa-1.66□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 AKAP13Q12802 2813 aa-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 TRPC5OSA6NMA1 111 aa-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 ANGPT1Q15389 498 aa-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 OR5AS1Q8N127 324 aa-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 OR10K1Q8NGX5 313 aa-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 PIGXQ8TBF5 258 aa-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 UCK1Q9HA47 277 aa-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 LY96Q9Y6Y9 160 aa-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 SPTBN4Q9H254 2564 aa-1.67□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 MUC17Q685J3 4493 aa-1.68□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa-1.68□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 DOCK5Q9H7D0 1870 aa-1.68□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 A6NN06 94 aa-1.68□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 IQCF5A8MTL0 148 aa-1.68□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 ISG15P05161 165 aa-1.68□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 C10orf111Q8N326 155 aa-1.68□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 HECW1Q76N89 1606 aa-1.69□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 GOLGA8KD6RF30 607 aa-1.69□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 PPIBP23284 216 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 PSMB6P28072 239 aa-1.69□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 CDK6Q00534 326 aa-1.69□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 C8orf74Q6P047 294 aa-1.69□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 OR51D1Q8NGF3 324 aa-1.69□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 CCL4L1Q8NHW4 92 aa-1.69□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 OR52E6Q96RD3 313 aa-1.69□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
SSB-208ENST00000468600 LIMD2Q9BT23 127 aa-1.69□□□□□ -2.68
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