RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443238.5

CHN1-208, Transcript of chimerin 1, human

TSL 4

Gene CHN1, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHN1-208	ENST00000443238	CLN5	O75503	358 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	CCNK	O75909	580 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	TCRB	P04435	133 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	IFNA4	P05014	189 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	OR10J1	P30954	320 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238		K7EMT4	169 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	TSPAN4	O14817	238 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	SYNGR2	O43760	224 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	DFFB	O76075	338 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	IL4	P05112	153 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	SLC25A4	P12235	298 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	IFITM3	Q01628	133 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	ZNF90	Q03938	601 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	OR2F1	Q13607	317 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238		A8MZ25	164 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	UPK1B	O75841	260 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	IFNA21	P01568	189 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	SLC25A6	P12236	298 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	NPPC	P23582	126 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	P2RY1	P47900	373 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	ASAH1	Q13510	395 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	GAMT	Q14353	236 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	METTL26	Q96S19	204 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238		U3KQ87	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	MED6	O75586	246 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	CRYBB3	P26998	211 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	PAX9	P55771	341 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	LYZ	P61626	148 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	RAB11A	P62491	216 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	DEFB135	Q30KP9	77 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238		Q8WTZ3	238 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHN1-208	ENST00000443238	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms