RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 SLC25A34Q6PIV7 304 aa13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 LYPD2Q6UXB3 125 aa13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 CCL17Q92583 94 aa13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PGLYRP4Q96LB8 373 aa13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 DYNLRB1Q9NP97 96 aa13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 AKAP13Q12802 2813 aa13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 B9A039 149 aa13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 H3BRN7 92 aa13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PTTG1IPP53801 180 aa13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 HCP5Q6MZN7 132 aa13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 INSIG2Q9Y5U4 225 aa13.41□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 DSPP15924 2871 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.4□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 FAM87AP0C7U9 286 aa13.4□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PSG1P11464 419 aa13.4□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 CSN1S1P47710 185 aa13.4□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PSMG4Q5JS54 123 aa13.4□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF493Q6ZR52 646 aa13.4□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 COX8CQ7Z4L0 72 aa13.4□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 MSRB2Q9Y3D2 182 aa13.4□□□□□ -0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PLCE1Q9P212 2302 aa13.39□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa13.39□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 TCF21O43680 179 aa13.39□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 S100A7P31151 101 aa13.39□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 LINC01545Q5VT33 79 aa13.39□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 ATOH7Q8N100 152 aa13.39□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 HTR1DP28221 377 aa13.38□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 LYZP61626 148 aa13.38□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.38□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 RPH3ALQ9UNE2 315 aa13.38□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 PLGLAQ15195 96 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 IGFBPL1Q8WX77 278 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 AP5S1Q9NUS5 200 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 CLEC5AQ9NY25 188 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SHISA9B4DS77 424 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 LY6LH3BQJ8 138 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SCGB2A1O75556 95 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 IGHV3-48P01763 117 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 RHOGP84095 191 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 PSG3Q16557 428 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 RPEQ96AT9 228 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 RITA1Q96K30 269 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.37□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa13.36□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 URB1O60287 2271 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 NAV3Q8IVL0 2385 aa13.36□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 OVOL3O00110 214 aa13.36□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 IGKV1-17P01599 117 aa13.36□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 MAJINQ3KP22 176 aa13.36□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa13.36□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa13.35□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 CT45A10P0DMU9 189 aa13.35□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 FBLN7Q53RD9 439 aa13.35□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.35□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 PRNTQ86SH4 94 aa13.35□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 DEFB125Q8N687 156 aa13.35□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 KIR3DL3Q8N743 410 aa13.35□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 PSG8Q9UQ74 426 aa13.35□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 U3KQK5 164 aa13.35□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 CCL25O15444 150 aa13.34□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 PSG9Q00887 426 aa13.34□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa13.34□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 NPBQ8NG41 125 aa13.34□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.34□□□□□ -0.27
HCLS1-202ENST00000428394 E7EQL1 145 aa13.33□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 K7EIM0 57 aa13.33□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 CD5LO43866 347 aa13.33□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 TOX4O94842 621 aa13.33□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 CEACAM3P40198 252 aa13.33□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.33□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 FA2HQ7L5A8 372 aa13.33□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 RNF125Q96EQ8 232 aa13.33□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa13.33□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 AAMDCQ9H7C9 122 aa13.33□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 FREM2Q5SZK8 3169 aa13.33□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 NDUFA3O95167 84 aa13.32□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 LINC01559Q495D7 138 aa13.32□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa13.32□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF747Q9BV97 191 aa13.32□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa13.32□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 NPIPB5A8MRT5 1133 aa13.32□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 CD3EP07766 207 aa13.32□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 COX8AP10176 69 aa13.32□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 SEC11AP67812 179 aa13.32□□□□□ -0.28
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF491Q8N8L2 437 aa13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms