RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 UBE2CO00762 179 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 ANAPC10Q9UM13 185 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 RFNGQ9Y644 331 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A1B0GV90 55 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 UBE2E1P51965 193 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 EVI2AP22794 236 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 Q6ZR03 302 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 GZMBP10144 247 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 PCNX1Q96RV3 2341 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 LCN12Q6JVE5 192 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 NLRC5Q86WI3 1866 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-203ENST00000409212 PSG3Q16557 428 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 WFDC12Q8WWY7 111 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 SSC4DQ8WTU2 575 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 REG4Q9BYZ8 158 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 SMPXQ9UHP9 88 aa12.89□□□□□ -0.35
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SH3BP4-203ENST00000409212 E9PQ18 207 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 WISP1O95388 367 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 CD28P10747 220 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 GFI1BQ5VTD9 330 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 HIST1H2BLQ99880 126 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 LYZL1Q6UWQ5 148 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 NDUFAF3Q9BU61 184 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 MSMBP08118 114 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 NDPQ00604 133 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 DTX2Q86UW9 622 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 IGLV1-44P01699 117 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 RBMY1CP0DJD4 496 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 MALP21145 153 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 ERVK11-1P61568 191 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.353e-15■■□□□ 13.2
SH3BP4-203ENST00000409212 PDE6HQ13956 83 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 RNF182Q8N6D2 247 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF524Q96C55 264 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 C5orf30Q96GV9 206 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 RCHY1Q96PM5 261 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 CFHR2P36980 270 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF329Q86UD4 541 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 IGKCP01834 107 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 LAGE3Q14657 143 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 MLANAQ16655 118 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 PIP4P1Q86T03 277 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM14BQ9NUH8 114 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 SH2D1AO60880 128 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 HIST3H2BBQ8N257 126 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 CHCHD5Q9BSY4 110 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 SPCS1Q9Y6A9 102 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A1B0GWB2 263 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF415Q09FC8 603 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 FCN3O75636 299 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 FANCMQ8IYD8 2048 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 A6NNC1 897 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 D6R8Y8 96 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 HEATR5AQ86XA9 2040 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 NBL1P41271 181 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 Q8TAT8 98 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 PRADC1Q9BSG0 188 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 DPH3P1Q9H4G8 78 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC25A2Q9BXI2 301 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 PLNP26678 52 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 WDR86Q86TI4 376 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 NUP35Q8NFH5 326 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 TTC32Q5I0X7 151 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 TEX36Q5VZQ5 186 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 LCNL1Q6ZST4 164 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 LINC00311Q8N616 119 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 GHRHP01286 108 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 AMBPP02760 352 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 MS4A6AQ9H2W1 248 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 LOXP28300 417 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-203ENST00000409212 NOTCH3Q9UM47 2321 aa12.84□□□□□ -0.35
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