RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 HIGD1CA8MV81 97 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 VWC2LB2RUY7 222 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 LY6LH3BQJ8 138 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 DLEU1O43261 78 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2J3O76001 311 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 GAGE1Q13065 139 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 A6NNC1 897 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 TOMM40O96008 361 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 LEMD1Q68G75 181 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 RPEQ96AT9 228 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLC1P0CG04 106 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLC2P0DOY2 106 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLC3P0DOY3 106 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 BORCS7Q96B45 105 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 LTAP01374 205 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 FMC1Q96HJ9 113 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8B2Q96RD0 313 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 Q9H3A6 140 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 I3L2K1 104 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 PSG1P11464 419 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 NTF3P20783 257 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF5Q99942 180 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 FBN2P35556 2912 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GXF2 115 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 TCRAP04437 139 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 H3BTX0 84 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF492Q9P255 531 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CHD6Q8TD26 2715 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 BATFQ16520 125 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 LYZP61626 148 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CT83Q5H943 113 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 HSBP1O75506 76 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SFTPCP11686 197 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMPP49913 170 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MMDQ15546 238 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 TCF24Q7RTU0 167 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 PMCHL1Q16048 86 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 NRGNQ92686 78 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 TIMD4Q96H15 378 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 OTORQ9NRC9 128 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 A8MWL6 223 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV1-17P01599 117 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 TIMM23O14925 209 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 PLGLAQ15195 96 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 GTSF1Q8WW33 167 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 NPSP0C0P6 89 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 LCN12Q6JVE5 192 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 P01737 135 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 LIPFP07098 398 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 M0R2Z0 102 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZN92 141 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 TXN2Q99757 166 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 C2orf70A6NJV1 201 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 K7EIM0 57 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 HBBP68871 147 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 CNIH1O95406 144 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLV2-11P01706 119 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 Q86TA4 180 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 GFRA4Q9GZZ7 299 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 TFPI2P48307 235 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2D3Q8NGH3 330 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 644.8 ms