RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM213A2RRL7 107 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-201ENST00000283228 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
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PTPRR-201ENST00000283228 PATE2Q6UY27 113 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-201ENST00000283228 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-201ENST00000283228 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-201ENST00000283228 SPRY3O43610 288 aa9.18□□□□□ -0.94
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PTPRR-201ENST00000283228 NCKAP5O14513 1909 aa9.16□□□□□ -0.94
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PTPRR-201ENST00000283228 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.15□□□□□ -0.94
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PTPRR-201ENST00000283228 LEPP41159 167 aa9.14□□□□□ -0.95
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PTPRR-201ENST00000283228 ZNF714Q96N38 554 aa9.14□□□□□ -0.95
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PTPRR-201ENST00000283228 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-201ENST00000283228 PATE3B3GLJ2 98 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-201ENST00000283228 CXCL12P48061 93 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-201ENST00000283228 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.13□□□□□ -0.95
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PTPRR-201ENST00000283228 TMEM189A5PLL7 270 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-201ENST00000283228 NDUFA3O95167 84 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-201ENST00000283228 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-201ENST00000283228 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRR-201ENST00000283228 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRR-201ENST00000283228 CT83Q5H943 113 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRR-201ENST00000283228 DDB2Q92466 427 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRR-201ENST00000283228 PTH2Q96A98 100 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRR-201ENST00000283228 M0R3E3 92 aa9.12□□□□□ -0.95
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