RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252211.6

ZKSCAN3-201, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZKSCAN3, Length 4,725 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC01619G3V211 115 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF138P52744 262 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PKIAP61925 76 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 E9PQ18 207 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NDUFB8O95169 186 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC00477Q96M19 166 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OSTCQ9NRP0 149 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PCP4P48539 62 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MLANAQ16655 118 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRSS2P07478 247 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DEFB112Q30KQ8 113 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C11orf53Q8IXP5 236 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RFNGQ9Y644 331 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C5orf52A6NGY3 159 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FOLR2P14207 255 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CACNG7P62955 275 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM50AO95807 157 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ELANEP08246 267 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TCTAP57738 103 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.81□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PPIFP30405 207 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PMCHL1Q16048 86 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q8NFD4 153 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NRGNQ92686 78 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NRN1Q9NPD7 142 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 WISP2O76076 250 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DTX2Q86UW9 622 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 AGMATQ9BSE5 352 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 F2Z2F3 143 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TCRAP04437 139 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ANAPC10Q9UM13 185 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF134P52741 427 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DEFB131AP59861 70 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LCN12Q6JVE5 192 aa9.8□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A1B0GV90 55 aa9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ATP5LO75964 103 aa9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 INSP01308 110 aa9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OCC1Q8TAD7 63 aa9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ST20Q9HBF5 79 aa9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 COL4A3Q01955 1670 aa9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FREM1Q5H8C1 2179 aa9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGHV4-59P01825 116 aa9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 H3BVH4 76 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LHBP01229 141 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR11H1Q8NG94 326 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RCHY1Q96PM5 261 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A6NDN8 102 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF415Q09FC8 603 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 COPS9Q8WXC6 57 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C7orf71A4D174 169 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A6NJY4 79 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PPBPP02775 128 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C18orf15Q96N68 181 aa9.78□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A087WWC5 75 aa9.77□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.77□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PSG3Q16557 428 aa9.77□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms