RNA–Protein interactions for RNA: YJL173C

RFA3, Transcript of Subunit of heterotrimeric Replication Protein A (RPA), yeast

Gene RFA3, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFA3	YJL173C	SEC12	P11655	471 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	TFC4	P33339	1025 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	IRC5	P43610	853 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	YDL183C	P48569	320 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	FOL1	P53848	824 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	FMP30	Q02883	468 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	YML122C	Q03207	126 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	YPT53	P36019	220 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	YJL193W	P39542	402 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	LRO1	P40345	661 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	ATG36	P46983	293 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	BUD17	P53727	317 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	PHM6	Q05637	104 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	ULA1	Q12059	462 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RFA3	YJL173C	HOP1	P20050	605 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	VPS33	P20795	691 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	CWH43	P25618	953 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	YMC1	P32331	307 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	LOT5	P34234	306 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	EAF5	P39995	279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	ARR3	Q06598	404 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	TGS1	Q12052	315 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	PCK1	P10963	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	VPS34	P22543	875 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	CNE1	P27825	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	PLC1	P32383	869 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	STL1	P39932	569 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	CPR8	P53728	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	COQ11	Q05892	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	MNT2	P53059	558 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	YGL117W	P53133	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	HOS1	Q12214	470 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	ORC2	P32833	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	COQ6	P53318	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	SLX4	Q12098	748 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	WHI2	P12611	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	BET2	P20133	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	AAD3	P25612	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	DSS4	P32601	143 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	CCL1	P37366	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	USA1	Q03714	838 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	ARG7	Q04728	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	PSF3	Q12146	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	ARG1	P22768	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	YIL092W	P40497	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	THI7	Q05998	598 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	OSW1	Q08692	278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	ERG11	P10614	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	PHO3	P24031	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	YNL018C	P53976	612 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	HOF1	Q05080	669 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFA3	YJL173C	URA3	P03962	267 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	PMA2	P19657	947 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	SAW1	P39735	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	MAD2	P40958	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	SAP4	P53036	818 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	YNR071C	P53757	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	NUR1	Q12066	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	MRPL9	P31334	269 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	TAF5	P38129	798 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	TAX4	P47030	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	TOM20	P35180	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	SDS22	P36047	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	SND1	Q04007	877 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	DIN7	Q12086	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	CBP3	P21560	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	TGL1	P34163	548 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	HOT13	P36078	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	STB5	P38699	743 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	GSM1	P42950	618 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	YJL043W	P47053	257 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFA3	YJL173C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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