RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	6.99	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	RASIP1	Q5U651	963 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	STK35	Q8TDR2	534 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	KCNB2	Q92953	911 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	RRAGC	Q9HB90	399 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	UBP1	Q9NZI7	540 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	IMPDH2	P12268	514 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	MAOB	P27338	520 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	ZNF165	P49910	485 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	SEPT6	Q14141	434 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	TREML4	Q6UXN2	200 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	REC114	Q7Z4M0	266 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	SVOP	Q8N4V2	548 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	GINM1	Q9NU53	330 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	PDE3A	Q14432	1141 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	FBXO11	Q86XK2	927 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	USP26	Q9BXU7	913 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EP300-208	ENST00000635538	GNB5	O14775	395 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	TM4SF5	O14894	197 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	CRK	P46108	304 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	RBL2	Q08999	1139 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	SEZ6	Q53EL9	994 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	NBPF4	Q96M43	638 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		6.96	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	SLFN14	P0C7P3	912 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	NLRP12	P59046	1061 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	LCE2C	Q5TA81	110 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	HDX	Q7Z353	690 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	WHAMM	Q8TF30	809 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		6.95	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538		A0A0A0MRY4	1105 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	MCM4	P33991	863 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	MLEC	Q14165	292 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	PODN	Q7Z5L7	613 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		6.94	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	DLL1	O00548	723 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	WIPF1	O43516	503 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	ARHGEF15	O94989	841 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	ATE1	O95260	518 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	PDE4B	Q07343	736 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	TNNI3K	Q59H18	835 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	FBXO27	Q8NI29	283 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	CRBN	Q96SW2	442 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		6.93	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	MEGF11	A6BM72	1044 aa		6.92	□□□□□ -1.3
EP300-208	ENST00000635538	ZNF862	O60290	1169 aa		6.92	□□□□□ -1.3

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