RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 POTEIP0CG38 1075 aa23.6■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 POTEJP0CG39 1038 aa23.6■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OSBP2Q969R2 916 aa23.6■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.59■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 APPBP2Q92624 585 aa23.59■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM227BQ96M60 508 aa23.59■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.59■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.59■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CLRN2A0PK11 232 aa23.59■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.58■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP40Q9NVE5 1235 aa23.58■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.57■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CACNB3P54284 484 aa23.57■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RHBDL3P58872 404 aa23.57■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 A0A0D9SFI3 127 aa23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 M0R2C6 588 aa23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYO1BO43795 1136 aa23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BAG3O95817 575 aa23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PPP4CP60510 307 aa23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MBD4O95243 580 aa23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TICAM2Q86XR7 235 aa23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LCORLQ8N3X6 602 aa23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARMT1Q9H993 441 aa23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GGA3Q9NZ52 723 aa23.56■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIF3CO14782 793 aa23.55■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHMLP26374 656 aa23.55■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 VEZTQ9HBM0 779 aa23.55■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.55■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AIDAQ96BJ3 306 aa23.54■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.54■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HIP1O00291 1037 aa23.54■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.54■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NFIAQ12857 509 aa23.53■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IL25Q9H293 177 aa23.53■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.53■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.52■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GPAA1O43292 621 aa23.52■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.52■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TEX11Q8IYF3 940 aa23.52■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.52■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLCG2P16885 1265 aa23.52■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRKAB2O43741 272 aa23.51■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LDHDQ86WU2 507 aa23.51■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.51■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PICALMQ13492 652 aa23.5■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.5■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.5■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.5■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDC45O75419 566 aa23.49■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TCP10Q12799 353 aa23.49■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IDI2Q9BXS1 227 aa23.49■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FOCADQ5VW36 1801 aa23.49■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.49■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DLK2Q6UY11 383 aa23.49■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CERS3Q8IU89 383 aa23.49■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.49■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.48■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.48■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CNTNAP1P78357 1384 aa23.48■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.47■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADM5C9JUS6 153 aa23.47■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP5P45974 858 aa23.47■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RASA3Q14644 834 aa23.47■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 VPS53Q5VIR6 699 aa23.47■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.47■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SULF1Q8IWU6 871 aa23.47■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.47■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FLT1P17948 1338 aa23.46■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.46■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.46■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP48Q86UV5 1035 aa23.46■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.46■■□□□ 1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms