RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 MXD3Q9BW11 206 aa30.96■■■□□ 2.55
SCAMP4-210ENST00000588555 NACAP1Q9BZK3 213 aa30.96■■■□□ 2.55
SCAMP4-210ENST00000588555 NAPBQ9H115 298 aa30.96■■■□□ 2.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF213O14771 459 aa30.95■■■□□ 2.55
SCAMP4-210ENST00000588555 RPS6KB1P23443 525 aa30.95■■■□□ 2.55
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP4CP60510 307 aa30.95■■■□□ 2.55
SCAMP4-210ENST00000588555 NLGN2Q8NFZ4 835 aa30.95■■■□□ 2.55
SCAMP4-210ENST00000588555 VPS33BQ9H267 617 aa30.95■■■□□ 2.55
SCAMP4-210ENST00000588555 GAKO14976 1311 aa30.95■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 DACT2Q5SW24 774 aa30.94■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 PDRG1Q9NUG6 133 aa30.94■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 PSME4Q14997 1843 aa30.94■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 AK2P54819 239 aa30.94■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 TIAM2Q8IVF5 1701 aa30.93■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 YDJCA8MPS7 323 aa30.93■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 TDO2P48775 406 aa30.92■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 GIMAP6Q6P9H5 292 aa30.92■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa30.92■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 USP17L3A6NCW0 530 aa30.92■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 USP17L4A6NCW7 530 aa30.92■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 USP17L1Q7RTZ2 530 aa30.92■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 SLF2Q8IX21 1173 aa30.92■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa30.91■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 TBC1D10CQ8IV04 446 aa30.91■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 BCS1LQ9Y276 419 aa30.91■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 BAG3O95817 575 aa30.9■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.9■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 TMX3Q96JJ7 454 aa30.9■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 NFKBIEO00221 500 aa30.89■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 BTDP43251 543 aa30.89■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 CERS3Q8IU89 383 aa30.89■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa30.89■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 TCEANC2Q96MN5 208 aa30.89■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa30.89■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa30.89■■■□□ 2.54
SCAMP4-210ENST00000588555 F8W031 263 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 TAOK3Q9H2K8 898 aa30.88■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa30.88■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa30.87■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 ANAPC4Q9UJX5 808 aa30.86■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa30.86■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 RHBDL3P58872 404 aa30.85■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 CTDSPL2Q05D32 466 aa30.85■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 TACC3Q9Y6A5 838 aa30.85■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 LTBP3Q9NS15 1303 aa30.85■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 LAMB1P07942 1786 aa30.84■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 PPARAQ07869 468 aa30.84■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 NCOA7Q8NI08 942 aa30.84■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 CUL4AQ13619 759 aa30.84■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 CTR9Q6PD62 1173 aa30.84■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 HHIPL2Q6UWX4 724 aa30.84■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 PLCG2P16885 1265 aa30.83■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 SCNN1DP51172 638 aa30.83■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 STAG1Q8WVM7 1258 aa30.83■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 MRIQ9BWK5 157 aa30.83■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa30.83■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 NEDD4P46934 1319 aa30.83■■■□□ 2.53
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD1Q15327 319 aa30.82■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 AKNAD1Q5T1N1 836 aa30.82■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA0825Q8IV33 1275 aa30.82■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 NKX2-3Q8TAU0 364 aa30.82■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 AGXT2Q9BYV1 514 aa30.82■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNRF3Q9ULT6 936 aa30.82■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 FOCADQ5VW36 1801 aa30.82■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 NAV1Q8NEY1 1877 aa30.82■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 USP17L12C9JPN9 530 aa30.82■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 USP17L21D6R901 530 aa30.82■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 DDIT3P35638 169 aa30.82■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 NIM1KQ8IY84 436 aa30.82■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 TEKT1Q969V4 418 aa30.82■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 SMIM22K7EJ46 135 aa30.81■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 SBK1Q52WX2 424 aa30.81■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 Q6ZUG5 572 aa30.81■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 INCENPQ9NQS7 918 aa30.81■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa30.8■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 MINDY4BA8MYZ0 360 aa30.8■■■□□ 2.52
SCAMP4-210ENST00000588555 LARGE1O95461 756 aa30.8■■■□□ 2.52
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