RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 GTF2A2P52657 109 aa22.69■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 DCAF15Q66K64 600 aa22.69■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.69■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.69■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 BCAR3O75815 825 aa22.68■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 OTUD5Q96G74 571 aa22.68■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 WRNIP1Q96S55 665 aa22.68■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 TNNQ9UQP3 1299 aa22.68■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.67■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.67■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 TIMM10P62072 90 aa22.67■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 CCL15Q16663 113 aa22.67■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.67■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 ERO1BQ86YB8 467 aa22.67■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 ERO1AQ96HE7 468 aa22.67■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.67■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.67■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 A0A1B0GUL7 405 aa22.66■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 TFCP2Q12800 502 aa22.66■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 NFIAQ12857 509 aa22.66■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 RASGRF1Q13972 1273 aa22.66■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 TRIM17Q9Y577 477 aa22.66■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 GAKO14976 1311 aa22.65■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 GNAI2P04899 355 aa22.65■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 XAGE2Q96GT9 111 aa22.65■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.65■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.65■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CTIF-206ENST00000588345 SP3Q02447 781 aa22.64■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 PPIL2Q13356 520 aa22.64■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.64■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.64■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 USP40Q9NVE5 1235 aa22.64■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 AK9Q5TCS8 1911 aa22.64■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 IRF6O14896 467 aa22.63■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 CETPP11597 493 aa22.63■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 TCP10Q12799 353 aa22.63■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.63■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.63■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.63■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 IDI2Q9BXS1 227 aa22.63■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.63■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.63■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.62■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 INPP5BP32019 993 aa22.62■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 PPATQ06203 517 aa22.62■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 SNAPC2Q13487 334 aa22.62■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 DOCK2Q92608 1830 aa22.61■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.61■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.61■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.61■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.61■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 ENTPD3O75355 529 aa22.6■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 CAP1Q01518 475 aa22.6■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 SLF2Q8IX21 1173 aa22.6■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 MIER1Q8N108 512 aa22.6■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 EFCC1Q9HA90 598 aa22.6■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 ABCF2Q9UG63 623 aa22.6■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 BTBD19C9JJ37 291 aa22.59■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.215e-6■■■□□ 15.8
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CTIF-206ENST00000588345 HTTP42858 3142 aa22.59■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 TLR2O60603 784 aa22.58■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 RGS3P49796 1198 aa22.58■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 POLA2Q14181 598 aa22.58■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.58■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.58■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.58■■□□□ 1.21
CTIF-206ENST00000588345 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.57■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.57■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 ZNF384Q8TF68 577 aa22.57■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.56■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 BTDP43251 543 aa22.56■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 MAP3K10Q02779 954 aa22.56■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 MECOMQ03112 1051 aa22.56■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 ARHGEF6Q15052 776 aa22.56■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 SPATA5Q8NB90 893 aa22.56■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 GPR108Q9NPR9 543 aa22.56■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.55■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.55■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 SSH3Q8TE77 659 aa22.55■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 ARMC5Q96C12 935 aa22.55■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CTIF-206ENST00000588345 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.54■■□□□ 1.2
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