RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMA5P28066 241 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 LBX1P52954 281 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TSGA10IPQ3SY00 556 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SNAP23O00161 211 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 RASEFQ8IZ41 740 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHDC4Q8TBB5 520 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 HAUS7Q99871 368 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 BOLA2Q9H3K6 86 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TAF5LO75529 589 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SULF1Q8IWU6 871 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CHMP3Q9Y3E7 222 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PTH1RQ03431 593 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO3BQ8WXR4 1341 aa30.26■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 HUNKP57058 714 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 TTLL5Q6EMB2 1281 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 LMBRD1Q9NUN5 540 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 EYA2O00167 538 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC57Q2TAC2 916 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 CD209Q9NNX6 404 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNJ4P48050 445 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ATG9AQ7Z3C6 839 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 CREB3L3Q68CJ9 461 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 MCTP1Q6DN14 999 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf69Q8N8R5 385 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 AK2P54819 239 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT32Q14532 448 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 NBPF9Q3BBW0 867 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 RUFY3Q7L099 469 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 CDCA5Q96FF9 252 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 MMP14P50281 582 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 PKP1Q13835 747 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD1Q15327 319 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 OGFOD1Q8N543 542 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXW7Q969H0 707 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 CASTP20810 708 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 GTF2IP78347 998 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM227BQ96M60 508 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ZIC5Q96T25 663 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 PDRG1Q9NUG6 133 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 WNT10BO00744 389 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 MBD3O95983 291 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 RGMBQ6NW40 437 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 BEGAINQ9BUH8 593 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0D9SFI3 127 aa30.2■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 NOGQ13253 232 aa30.2■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 KBTBD3Q8NAB2 608 aa30.2■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 DBNDD2Q9BQY9 259 aa30.2■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC27A2O14975 620 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 IL1R1P14778 569 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF445P59923 1031 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GUL6 1792 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 TAF7LQ5H9L4 462 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 CNNM1Q9NRU3 951 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 AKAP2Q9Y2D5 859 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA0825Q8IV33 1275 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 GRPEL1Q9HAV7 217 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 CERS5Q8N5B7 392 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 HELLSQ9NRZ9 838 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 CAPN15O75808 1086 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC102AQ96A19 550 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 BRPF3Q9ULD4 1205 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF804AQ7Z570 1209 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 CA12O43570 354 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP126Q9P2H0 1117 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-204ENST00000587718 FKBP1BP68106 108 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 TSKSQ9UJT2 592 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 HDAC9Q9UKV0 1011 aa30.13■■■□□ 2.41
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