RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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SPNS2-204ENST00000571386 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 ARMC5Q96C12 935 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-204ENST00000571386 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-204ENST00000571386 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-204ENST00000571386 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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SPNS2-204ENST00000571386 UNCXA6NJT0 531 aa20.5■□□□□ 0.87
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SPNS2-204ENST00000571386 HOOK2Q96ED9 719 aa20.48■□□□□ 0.87
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SPNS2-204ENST00000571386 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.48■□□□□ 0.87
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SPNS2-204ENST00000571386 POLA2Q14181 598 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS2-204ENST00000571386 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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SPNS2-204ENST00000571386 ABCF2Q9UG63 623 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS2-204ENST00000571386 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.45■□□□□ 0.86
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SPNS2-204ENST00000571386 ZNF333Q96JL9 665 aa20.45■□□□□ 0.86
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SPNS2-204ENST00000571386 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 DCAF15Q66K64 600 aa20.42■□□□□ 0.86
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SPNS2-204ENST00000571386 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 SPATA5Q8NB90 893 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 ELP3Q9H9T3 547 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 USP40Q9NVE5 1235 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 TNNI3KQ59H18 835 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 CEP85Q6P2H3 762 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 FAM151AQ8WW52 585 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS2-204ENST00000571386 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.4■□□□□ 0.86
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SPNS2-204ENST00000571386 MAP3K9P80192 1104 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 TCP10Q12799 353 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 NBPF11Q86T75 865 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 VGLL4Q14135 290 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 WRNIP1Q96S55 665 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS2-204ENST00000571386 LAMA3Q16787 3333 aa20.37■□□□□ 0.85
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