RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	FSD2	A1L4K1	749 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC102B	Q68D86	513 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	VPS37D	Q86XT2	251 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	NECAB1	Q8N987	351 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	SHTN1	A0MZ66	631 aa		12.02	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	PSMD14	O00487	310 aa		12.02	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	YY1	P25490	414 aa		12.02	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	GTF2I	P78347	998 aa		12.02	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		12.02	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	COA1	Q9GZY4	146 aa		12.02	□□□□□ -0.48
TCF4-231	ENST00000566279	FOXP2	O15409	715 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	APPBP2	Q92624	585 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	VPS33B	Q9H267	617 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	DOCK2	Q92608	1830 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	TCHH	Q07283	1943 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	SYT1	P21579	422 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	GJB2	P29033	226 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	STX6	O43752	255 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	IL1R1	P14778	569 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	PODN	Q7Z5L7	613 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	12.01	□□□□□ -0.49	2e-6	■■■■□ 26.4
TCF4-231	ENST00000566279	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		12	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	ADD2	P35612	726 aa		12	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	RASGRF1	Q13972	1273 aa		12	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	GRIK5	Q16478	980 aa		12	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		12	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279		Q6ZUG5	572 aa		12	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	CERS5	Q8N5B7	392 aa		12	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		12	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	GLTPD2	A6NH11	291 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279		F8W031	263 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	DTNB	O60941	627 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279		E7EWF7	191 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	GPAA1	O43292	621 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	SCNN1D	P51172	638 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	GPT2	Q8TD30	523 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	POTEC	B2RU33	542 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	UBE3C	Q15386	1083 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	GPC2	Q8N158	579 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	MTMR6	Q9Y217	621 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	F13A1	P00488	732 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	EGFR	P00533	1210 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	PDE6A	P16499	860 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	GTF3C6	Q969F1	213 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	RRAGC	Q9HB90	399 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	WDR90	Q96KV7	1748 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	FGA	P02671	866 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	EPS15	P42566	896 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	STK3	Q13188	491 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	BRF1	Q92994	677 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	TNIP1	Q15025	636 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49

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