RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561191.1

USP3-AS1-209, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene USP3-AS1, Length 572 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-209ENST00000561191 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 BTDP43251 543 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 GSTO1P78417 241 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 GOLIM4O00461 696 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 NFIAQ12857 509 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 KLRG1Q96E93 195 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 TEPSINQ96N21 525 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 HAUS7Q99871 368 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP40Q9NVE5 1235 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 PCNTO95613 3336 aa22.6■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 RHBDL3P58872 404 aa22.6■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 AK9Q5TCS8 1911 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 LDHCP07864 332 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 MOB2Q70IA6 237 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 FAM83AQ86UY5 434 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 GPATCH3Q96I76 525 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 IGSF3O75054 1194 aa22.58■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 TNNI2P48788 182 aa22.58■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 HUNKP57058 714 aa22.58■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 FZD1Q9UP38 647 aa22.58■■□□□ 1.21
USP3-AS1-209ENST00000561191 MX1P20591 662 aa22.57■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 NF2P35240 595 aa22.57■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 FKBP1BP68106 108 aa22.57■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.57■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.57■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.57■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.57■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 CYP7A1P22680 504 aa22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 TCP10Q12799 353 aa22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 MAP3K12Q12852 859 aa22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 IDI2Q9BXS1 227 aa22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 LNPKQ9C0E8 428 aa22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 PDE6AP16499 860 aa22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 VEGFBP49765 207 aa22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 RGS3P49796 1198 aa22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 NUCB1Q02818 461 aa22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 PRKG1Q13976 671 aa22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 SIPA1L1O43166 1804 aa22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 FAM151AQ8WW52 585 aa22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 PPP4CP60510 307 aa22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 CAPNS2Q96L46 248 aa22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 ENTPD3O75355 529 aa22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 CHGBP05060 677 aa22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 PICALMQ13492 652 aa22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 TEX11Q8IYF3 940 aa22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 STAP2Q9UGK3 403 aa22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-209ENST00000561191 MYH1P12882 1939 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 LAMB1P07942 1786 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 ERC2O15083 957 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 BAG3O95817 575 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-209ENST00000561191 PDE1AP54750 535 aa22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms