RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560622.5

USP3-AS1-207, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 508 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRDX5P30044 214 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 NFIAQ12857 509 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 MOGSQ13724 837 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF333Q96JL9 665 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 CSADQ9Y600 493 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 CTGFP29279 349 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 INPP5BP32019 993 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 ERO1BQ86YB8 467 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 DOCK1Q14185 1865 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 MAST3O60307 1309 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZBTB22O15209 634 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 CIAO1O76071 339 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLC5A1P13866 664 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 PPIL2Q13356 520 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM151AQ8WW52 585 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 TLR2O60603 784 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 PHKA1P46020 1223 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 SIL1Q9H173 461 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADORA1P30542 326 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 FBXO3Q9UK99 471 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 CETPP11597 493 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 ATP2B3Q16720 1220 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 SIPA1L1O43166 1804 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 PPATQ06203 517 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 TCP10Q12799 353 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 SNAPC2Q13487 334 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 C17orf99Q6UX52 265 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 MEIS3Q99687 375 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 COPRSQ9NQ92 184 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLURP2P0DP57 97 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 DCAF15Q66K64 600 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF384Q8TF68 577 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 GAKO14976 1311 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCDC102BQ68D86 513 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 HOOK2Q96ED9 719 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 FOCADQ5VW36 1801 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 MAP3K10Q02779 954 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 RASGRF1Q13972 1273 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 IDI2Q9BXS1 227 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 USP40Q9NVE5 1235 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 SEMA3EO15041 775 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 TIMM10P62072 90 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRIM47Q96LD4 638 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 CPA4Q9UI42 421 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 TNNQ9UQP3 1299 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 PDHXO00330 501 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 RGS3P49796 1198 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 MTX1Q13505 466 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 SHISA4Q96DD7 197 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 LAMA3Q16787 3333 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 ALPK3Q96L96 1907 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 BCRP11274 1271 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms