RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
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TMEM260-216ENST00000557657 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
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TMEM260-216ENST00000557657 SPTLC2O15270 562 aa24.68■■□□□ 1.54
TMEM260-216ENST00000557657 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
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TMEM260-216ENST00000557657 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.59■■□□□ 1.53
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TMEM260-216ENST00000557657 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.58■■□□□ 1.53
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TMEM260-216ENST00000557657 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.58■■□□□ 1.53
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