RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.67■□□□□ 0.1
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15.67■□□□□ 0.1
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.67■□□□□ 0.1
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa15.67■□□□□ 0.1
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAGEB6Q8N7X4 407 aa15.64■□□□□ 0.09
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 USP40Q9NVE5 1235 aa15.64■□□□□ 0.09
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 BAG3O95817 575 aa15.63■□□□□ 0.09
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDE1AP54750 535 aa15.63■□□□□ 0.09
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.63■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF408Q9H9D4 720 aa15.63■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SSC5DA1L4H1 1573 aa15.62■□□□□ 0.09
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.61■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 OSBPL3Q9H4L5 887 aa15.61■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa15.6■□□□□ 0.09
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.6■□□□□ 0.09
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.6■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TLL2Q9Y6L7 1015 aa15.6■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF532Q9HCE3 1301 aa15.6■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RGS3P49796 1198 aa15.59■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBE3CQ15386 1083 aa15.59■□□□□ 0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TEX11Q8IYF3 940 aa15.59■□□□□ 0.09
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SAPCD2Q86UD0 394 aa15.58■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MIGA1Q8NAN2 632 aa15.58■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HOOK2Q96ED9 719 aa15.58■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.58■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.58■□□□□ 0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 THSD7BQ9C0I4 1608 aa15.57■□□□□ 0.08
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