RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 FAM193AP78312 1265 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 FSTL1Q12841 308 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 KDM4AO75164 1064 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 BTDP43251 543 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 MMP14P50281 582 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 CACNB3P54284 484 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 MX1P20591 662 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 KIF22Q14807 665 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TTC6Q86TZ1 520 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SH3BP5O60239 455 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 KLRK1P26718 216 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 CSRNP1Q96S65 589 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 NAPBQ9H115 298 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 MCM9Q9NXL9 1143 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 C4AP0C0L4 1744 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 CLGNO14967 610 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ZAP70P43403 619 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ARHGEF6Q15052 776 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SSH3Q8TE77 659 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ADM5C9JUS6 153 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 FZD9O00144 591 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 HIP1O00291 1037 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 HSPA6P17066 643 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 RFX1P22670 979 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 RASA3Q14644 834 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 CERS3Q8IU89 383 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD62A6NC57 917 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-206ENST00000548122 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 ERICH2A1L162 156 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 PRDX5P30044 214 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-206ENST00000548122 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-206ENST00000548122 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 WRNIP1Q96S55 665 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 DLG5Q8TDM6 1919 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 TRAF5O00463 557 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 RASGRF1Q13972 1273 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRB-206ENST00000548122 RTL9Q8NET4 1388 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC102AQ96A19 550 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 CASP7P55210 303 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 DACT2Q5SW24 774 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 PI16Q6UXB8 463 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 OTUD5Q96G74 571 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 GPR108Q9NPR9 543 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 HMG20BQ9P0W2 317 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 LY75O60449 1722 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 YDJCA8MPS7 323 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 CAPN15O75808 1086 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 MBD4O95243 580 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-206ENST00000548122 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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