RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548025.5

MARF1-205, Transcript of meiosis regulator and mRNA stability factor 1, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MARF1, Length 5,891 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MARF1-205	ENST00000548025	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MARF1-205	ENST00000548025	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
MARF1-205	ENST00000548025	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
MARF1-205	ENST00000548025	PTPRT	O14522	1441 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MARF1-205	ENST00000548025	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
MARF1-205	ENST00000548025	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MARF1-205	ENST00000548025	LMAN1	P49257	510 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MARF1-205	ENST00000548025	STK3	Q13188	491 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MARF1-205	ENST00000548025	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MARF1-205	ENST00000548025	ME1	P48163	572 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	CCDC14	Q49A88	953 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	URGCP	Q8TCY9	931 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	POTEB2	H3BUK9	544 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	KIF11	P52732	1056 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	TAF4B	Q92750	862 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	CDHR1	Q96JP9	859 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	MYL3	P08590	195 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	PZP	P20742	1482 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	KIFC2	Q96AC6	838 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	MAP3K7	O43318	606 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	E2F5	Q15329	346 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	CHST3	Q7LGC8	479 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	RAB23	Q9ULC3	237 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	TRPC3	Q13507	836 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	FAM182B	Q5T319	152 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	NOX5	Q96PH1	765 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	KRT79	Q5XKE5	535 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	AAAS	Q9NRG9	546 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	RTN1	Q16799	776 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	C8orf76	Q96K31	380 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	GRAP	Q13588	217 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	FNBP1	Q96RU3	617 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	GCKR	Q14397	625 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	TNS4	Q8IZW8	715 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	ERVK-7	P63135	1459 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	DAAM2	Q86T65	1068 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	FAM89A	Q96GI7	184 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	MSRA	Q9UJ68	235 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	DDX12P	Q92771	950 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	CSRNP1	Q96S65	589 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	CTSW	P56202	376 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	WDR44	Q5JSH3	913 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	KANK3	Q6NY19	840 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	RMND1	Q9NWS8	449 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	PTCH1	Q13635	1447 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	ALAS1	P13196	640 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	CRB1	P82279	1406 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	CA12	O43570	354 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	GTF2A2	P52657	109 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	METTL13	Q8N6R0	699 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	PANK1	Q8TE04	598 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	NARF	Q9UHQ1	456 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	APLP1	P51693	650 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	PLVAP	Q9BX97	442 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	NEK4	P51957	841 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	EYA2	O00167	538 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	OAT	P04181	439 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MARF1-205	ENST00000548025	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47

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