RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 UBE4AQ14139 1066 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 BACH1O14867 736 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 RIMBP2O15034 1052 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 TCIRG1Q13488 830 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 FNBP1Q96RU3 617 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 USP21Q9UK80 565 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 NLRP1Q9C000 1473 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 SPC25Q9HBM1 224 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 STX10O60499 249 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 F13A1P00488 732 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 MCM7P33993 719 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 TTC14Q96N46 770 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 M0QZ92 97 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 OPA1O60313 960 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 BAG6P46379 1132 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 RILPL1Q5EBL4 403 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ANXA1P04083 346 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGEF6Q15052 776 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1B0GUL7 405 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 DNM2P50570 870 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 TUBB2AQ13885 445 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA24Q86W54 205 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 NUP58Q9BVL2 599 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 EYA2O00167 538 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ATP5DP30049 168 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ATP10DQ9P241 1426 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 CFAP58Q5T655 872 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 KIF20BQ96Q89 1820 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 CNGA4Q8IV77 575 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 RGS22Q8NE09 1264 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 IQCDQ96DY2 449 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 FAM212AQ96EL1 285 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 MYOM2P54296 1465 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 PTPRKQ15262 1439 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 RPS6KB1P23443 525 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 UBXN1Q04323 297 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 IWS1Q96ST2 819 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 SLAIN2Q9P270 581 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 P4HA1P13674 534 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 DCAF15Q66K64 600 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 DHX58Q96C10 678 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 NOD1Q9Y239 953 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 KIAA0232Q92628 1395 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 IGHDP01880 384 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 GNG11P61952 73 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 TNNI3KQ59H18 835 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 USP48Q86UV5 1035 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 ISM2Q6H9L7 571 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 NECAB1Q8N987 351 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC42Q96M95 316 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-226ENST00000546160 GNA14O95837 355 aa7.18□□□□□ -1.26
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