RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538734.6

MIR9-3HG-202, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 2

Gene MIR9-3HG, Length 1,877 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SOGA3Q5TF21 947 aa24.23■■□□□ 1.47
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.22■■□□□ 1.47
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 ANTXR2P58335 489 aa24.12■■□□□ 1.45
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 SBK1Q52WX2 424 aa24.12■■□□□ 1.45
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.12■■□□□ 1.45
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.12■■□□□ 1.45
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 MRIQ9BWK5 157 aa24.12■■□□□ 1.45
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
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