RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538354.5

TULP3-203, Transcript of tubby like protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TULP3, Length 1,229 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3-203ENST00000538354 FBXO3Q9UK99 471 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP3-203ENST00000538354 CSADQ9Y600 493 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP3-203ENST00000538354 AK9Q5TCS8 1911 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP3-203ENST00000538354 MTX1Q13505 466 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 FAM83AQ86UY5 434 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 WRNIP1Q96S55 665 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 CAP1Q01518 475 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 TCP10Q12799 353 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 CCL15Q16663 113 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 PANK1Q8TE04 598 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 COPRSQ9NQ92 184 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 NFIAQ12857 509 aa24.18■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 FKBP1CQ5VVH2 108 aa24.18■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 GTF2A2P52657 109 aa24.17■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 TIMM10P62072 90 aa24.17■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.17■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 MYH2Q9UKX2 1941 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 SRGAP3O43295 1099 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 CCDC102BQ68D86 513 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 INPP5BP32019 993 aa24.15■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 TFCP2Q12800 502 aa24.15■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 ERO1AQ96HE7 468 aa24.15■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 USP40Q9NVE5 1235 aa24.15■■□□□ 1.46
TULP3-203ENST00000538354 SP3Q02447 781 aa24.14■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 PDE3AQ14432 1141 aa24.14■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.14■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 FAM151AQ8WW52 585 aa24.14■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.14■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.13■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 A0A1B0GUL7 405 aa24.13■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 IRF6O14896 467 aa24.13■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 RASGRF1Q13972 1273 aa24.13■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 DCAF15Q66K64 600 aa24.13■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 ERO1BQ86YB8 467 aa24.13■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.13■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 HTTP42858 3142 aa24.13■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.12■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 SEMA3EO15041 775 aa24.12■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 HOOK2Q96ED9 719 aa24.12■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 XAGE2Q96GT9 111 aa24.12■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 EFCC1Q9HA90 598 aa24.12■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.11■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 ABCF2Q9UG63 623 aa24.11■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.11■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.11■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 BTBD19C9JJ37 291 aa24.1■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 PPIL2Q13356 520 aa24.1■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.1■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.09■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 CETPP11597 493 aa24.09■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 COG6Q9Y2V7 657 aa24.09■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 DOCK2Q92608 1830 aa24.09■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 SLURP2P0DP57 97 aa24.08■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 RGS3P49796 1198 aa24.08■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 ATP8B2P98198 1209 aa24.08■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 SNAPC2Q13487 334 aa24.08■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 PI16Q6UXB8 463 aa24.08■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.08■■□□□ 1.45
TULP3-203ENST00000538354 POTEFA5A3E0 1075 aa24.07■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 POLA2Q14181 598 aa24.07■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.07■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 SSH3Q8TE77 659 aa24.07■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.07■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.07■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 GAKO14976 1311 aa24.07■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 PPATQ06203 517 aa24.06■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.06■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.06■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 BTDP43251 543 aa24.05■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.05■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.04■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 MECOMQ03112 1051 aa24.04■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 PICALMQ13492 652 aa24.04■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 CEP85Q6P2H3 762 aa24.04■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.04■■□□□ 1.44
TULP3-203ENST00000538354 ZNF384Q8TF68 577 aa24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms