RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.33□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.33□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.33□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.32□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 MAP4K1Q92918 833 aa14.32□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.32□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.32□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.32□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 APPP05067 770 aa14.31□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 PTH1RQ03431 593 aa14.31□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 CFAP100Q494V2 611 aa14.31□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.31□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.31□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 ZMYM6O95789 1325 aa14.31□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.31□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 DLGAP5Q15398 846 aa14.3□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 ALX1Q15699 326 aa14.3□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 VPS53Q5VIR6 699 aa14.3□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 RNF20Q5VTR2 975 aa14.3□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.3□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.3□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 TEX11Q8IYF3 940 aa14.3□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.3□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.3□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.3□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 USP5P45974 858 aa14.29□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 TDO2P48775 406 aa14.29□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 NAPBQ9H115 298 aa14.29□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 H7C1D1 291 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 MYO1BO43795 1136 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 SPDYE6P0CI01 402 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 HSPA4P34932 840 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 RHBDL3P58872 404 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 FOCADQ5VW36 1801 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 MICALL2Q8IY33 904 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 USP40Q9NVE5 1235 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.27□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 LAMA4Q16363 1823 aa14.27□□□□□ -0.12
LMO3-218ENST00000538020 FOXP2O15409 715 aa14.27□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 PRKAB2O43741 272 aa14.27□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 FGAP02671 866 aa14.27□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 ANAPC15P60006 121 aa14.27□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 NECTIN1Q15223 517 aa14.27□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.27□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.27□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.27□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.26□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.26□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 LAMB1P07942 1786 aa14.26□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 FLT1P17948 1338 aa14.25□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 GLTPD2A6NH11 291 aa14.25□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 ZNF213O14771 459 aa14.25□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 SLC27A2O14975 620 aa14.25□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 KRT32Q14532 448 aa14.25□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 KCNB2Q92953 911 aa14.25□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 IDI2Q9BXS1 227 aa14.25□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.25□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 WNT10BO00744 389 aa14.24□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.24□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.24□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 SBK1Q52WX2 424 aa14.24□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.24□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.24□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.24□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.24□□□□□ -0.13
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