RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530978.1

RBM25-208, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 2

Gene RBM25, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	GAK	O14976	1311 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	TOMM70	O94826	608 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	ADD2	P35612	726 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	TTC22	Q5TAA0	569 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	USP48	Q86UV5	1035 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	USP40	Q9NVE5	1235 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	11	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	MYO1B	O43795	1136 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	LDHC	P07864	332 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	NFIA	Q12857	509 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	SLF2	Q8IX21	1173 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	CNTROB	Q8N137	903 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	MRI	Q9BWK5	157 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	10.99	□□□□□ -0.65	2e-6	■■■■□ 22.5
RBM25-208	ENST00000530978	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	MMP14	P50281	582 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	RHBDL3	P58872	404 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	TCP10	Q12799	353 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	PICALM	Q13492	652 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	SULF1	Q8IWU6	871 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	LCORL	Q8N3X6	602 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	EVI5L	Q96CN4	794 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	ARMT1	Q9H993	441 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	CNTNAP1	P78357	1384 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978		M0R2C6	588 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	MBD4	O95243	580 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	SDS	P20132	328 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	TEX11	Q8IYF3	940 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	CDCA5	Q96FF9	252 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	BAG3	O95817	575 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	RASA3	Q14644	834 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	UBE3C	Q15386	1083 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	APPBP2	Q92624	585 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	OSBP2	Q969R2	916 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	FAM227B	Q96M60	508 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	FZD1	Q9UP38	647 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM25-208	ENST00000530978	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		10.95	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		10.95	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	PASK	Q96RG2	1323 aa		10.95	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978		A0A0D9SFI3	127 aa		10.95	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	PRKAB2	O43741	272 aa		10.95	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	SLURP2	P0DP57	97 aa		10.95	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	FSTL1	Q12841	308 aa		10.95	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	PRKG1	Q13976	671 aa		10.95	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		10.95	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	FLT1	P17948	1338 aa		10.94	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	SIPA1L1	O43166	1804 aa		10.94	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	IGSF3	O75054	1194 aa		10.94	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	10.94	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	TNNI2	P48788	182 aa		10.94	□□□□□ -0.66
RBM25-208	ENST00000530978	PPP4C	P60510	307 aa		10.94	□□□□□ -0.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms